pcvolkmer/bzkf-rwdp-check
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Paul-Christian Volkmer
2024-02-23 12:47:37 +01:00
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# BZKF Real World Data Platform - Plausibilitätsprüfung
Anwendung zur Durchführung einer Plausibilitätsprüfung anhand der Daten für die BZKF Real World Data Platform.
## Aufbau der ETL-Strecke an den Standorten
Die Daten werden aus der Onkostar-Datenbank ausgelesen und in Apache-Kafka eingespeist.
Nach Durchlauf der ETL-Strecke wird das Ergebnis in einer CSV-Datei gespeichert.
Diese wird dann (aktuell) manuell in OPAL importiert.
```mermaid
flowchart LR
A[Database] --> B[Kafka-Connect]
B --> C[ADT to FHIR]
C --> D[fhir-pseudonymizer]
D --> E[obds-fhir-to-opal]
E -->|CSV-File| F[OPAL]
```
## Prüfung der Daten in der CSV-Datei
Vor Veröffentlichung der Daten der CSV-Datei in Opal kann die Anzahl der _Conditions_, gruppiert nach ICD-10 Gruppen,
mit dem Befehl `opal-file` aus der CSV-Datei gewonnen werden.
```
bzkf-rwdp-check opal-file --file <Opal-CSV-Datei>.csv
```
Die Anwendung gibt nun eine Liste der ICD-10-Gruppen mit Anzahl der _Conditions_ aus.