chore: bump version

README.md

@@ -1,48 +1,30 @@
 # ETL-Processor for DNPM:DIP [![Run Tests](https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/actions/workflows/test.yml/badge.svg)](https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/actions/workflows/test.yml)
 
-Diese Anwendung versendet ein bwHC-MTB-File im bwHC-Datenmodell 1.0 an DNPM:DIP und pseudonymisiert
+Diese Anwendung versendet ein bwHC-MTB-File im bwHC-Datenmodell 1.0 an DNPM:DIP und pseudonymisiert die Patienten-ID.
-die Patienten-ID.
 
 ## Einordnung innerhalb einer DNPM-ETL-Strecke
 
-Diese Anwendung erlaubt das Entgegennehmen von HTTP/REST-Anfragen aus dem Onkostar-Plugin *
+Diese Anwendung erlaubt das Entgegennehmen von HTTP/REST-Anfragen aus dem Onkostar-Plugin **[onkostar-plugin-dnpmexport](https://github.com/CCC-MF/onkostar-plugin-dnpmexport)**.
-*[onkostar-plugin-dnpmexport](https://github.com/CCC-MF/onkostar-plugin-dnpmexport)**.
 
 Der Inhalt einer Anfrage, wenn ein bwHC-MTBFile, wird pseudonymisiert und auf Duplikate geprüft.
 Duplikate werden verworfen, Änderungen werden weitergeleitet.
 
 Löschanfragen werden immer als Löschanfrage an DNPM:DIP weitergeleitet.
 
-Zudem ist eine minimalistische Weboberfläche integriert, die einen Einblick in den aktuellen Zustand
+Zudem ist eine minimalistische Weboberfläche integriert, die einen Einblick in den aktuellen Zustand der Anwendung gewährt.
-der Anwendung gewährt.
 
 ![Modell DNPM-ETL-Strecke](docs/etl.png)
 
 ### Duplikaterkennung
 
-Die Erkennung von Duplikaten ist normalerweise immer aktiv, kann jedoch über den
+Die Erkennung von Duplikaten ist normalerweise immer aktiv, kann jedoch über den Konfigurationsparameter
-Konfigurationsparameter
 `APP_DUPLICATION_DETECTION=false` deaktiviert werden.
 
-### Modelvorhaben genomDE §64e
-
-Zusätzlich zur Patienten Identifier Pseudonymisierung müssen Vorgangsummern generiert werden, die
-jede Übertragung eindeutig identifizieren aber gleichzeitig dem Patienten zugeordnet werden können.
-Dies lässt sich durch weitere Pseudonyme abbilden, allerdings werden pro Originalwert mehrere
-Pseudonyme benötigt.
-Zu diesem Zweck muss in gPas eine **Multi-Pseudonym-Domäne** konfiguriert werden (siehe auch
-*APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_CCDN*).
-
-**WICHTIG:** Deaktivierte Pseudonymisierung ist nur für Tests nutzbar. Vorgangsummern sind zufällig
-und werden anschließend verworfen.
-
 ### Datenübermittlung über HTTP/REST
 
-Anfragen werden, wenn nicht als Duplikat behandelt, nach der Pseudonymisierung direkt an DNPM:DIP
+Anfragen werden, wenn nicht als Duplikat behandelt, nach der Pseudonymisierung direkt an DNPM:DIP gesendet.
-gesendet.
 
-Ein HTTP Request kann, angenommen die Installation erfolgte auf dem Host `dnpm.example.com` an
+Ein HTTP Request kann, angenommen die Installation erfolgte auf dem Host `dnpm.example.com` an nachfolgende URLs gesendet werden:
-nachfolgende URLs gesendet werden:
 
 | HTTP-Request | URL                                     | Consent-Status im Datensatz | Bemerkung                                                                       |
 |--------------|-----------------------------------------|-----------------------------|---------------------------------------------------------------------------------|
@@ -50,15 +32,12 @@ nachfolgende URLs gesendet werden:
 | `POST`       | `https://dnpm.example.com/mtb`          | `REJECT`                    | Die Anwendung sendet einen Lösch-Request für die im Datensatz angegebene Pat-ID |
 | `DELETE`     | `https://dnpm.example.com/mtb/12345678` | -                           | Die Anwendung sendet einen Lösch-Request für Pat-ID `12345678`                  |
 
-Anstelle des Pfads `/mtb` kann auch, wie in Version 0.9 und älter üblich, `/mtbfile` verwendet
+Anstelle des Pfads `/mtb` kann auch, wie in Version 0.9 und älter üblich, `/mtbfile` verwendet werden.
-werden.
 
 ### Datenübermittlung mit Apache Kafka
 
-Anfragen werden, wenn nicht als Duplikat behandelt, nach der Pseudonymisierung an Apache Kafka
+Anfragen werden, wenn nicht als Duplikat behandelt, nach der Pseudonymisierung an Apache Kafka übergeben.
-übergeben.
+Eine Antwort wird dabei ebenfalls mithilfe von Apache Kafka übermittelt und nach der Entgegennahme verarbeitet.
-Eine Antwort wird dabei ebenfalls mithilfe von Apache Kafka übermittelt und nach der Entgegennahme
-verarbeitet.
 
 Siehe hierzu auch: https://github.com/CCC-MF/kafka-to-bwhc
 
@@ -66,19 +45,17 @@ Siehe hierzu auch: https://github.com/CCC-MF/kafka-to-bwhc
 
 ### 🔥 Wichtige Änderungen in Version 0.10
 
-Ab Version 0.10 wird [DNPM:DIP](https://github.com/dnpm-dip) unterstützt und als Standardendpunkt
+Ab Version 0.10 wird [DNPM:DIP](https://github.com/dnpm-dip) unterstützt und als Standardendpunkt verwendet.
-verwendet.
+Soll noch das alte bwHC-Backend verwendet werden, so ist die Umgebungsvariable  `APP_REST_IS_BWHC` auf `true` zu setzen.
-Soll noch das alte bwHC-Backend verwendet werden, so ist die Umgebungsvariable  `APP_REST_IS_BWHC`
-auf `true` zu setzen.
 
 ### 🔥 Breaking Changes nach Version 0.10
 
-In Versionen des ETL-Processors **nach Version 0.10** werden die folgenden Konfigurationsoptionen
+In Versionen des ETL-Processors **nach Version 0.10** werden die folgenden Konfigurationsoptionen entfernt:
-entfernt:
 
+* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_SSLCALOCATION`: Nutzen Sie hier, wie unter [_Integration eines eigenen Root CA
+  Zertifikats_](#integration-eines-eigenen-root-ca-zertifikats) beschrieben, das Einbinden eigener Zertifikate.
 * `APP_KAFKA_TOPIC`: Nutzen Sie nun die Konfigurationsoption `APP_KAFKA_OUTPUT_TOPIC`
-* `APP_KAFKA_RESPONSE_TOPIC`: Nutzen Sie nun die Konfigurationsoption
+* `APP_KAFKA_RESPONSE_TOPIC`: Nutzen Sie nun die Konfigurationsoption `APP_KAFKA_OUTPUT_RESPONSE_TOPIC`
-  `APP_KAFKA_OUTPUT_RESPONSE_TOPIC`
 
 Der Pfad zum Versenden von MTB-Daten ist nun offiziell `/mtb`.
 In Versionen **nach Version 0.10** wird die Unterstützung des Pfads `/mtbfile` entfernt.
@@ -91,37 +68,39 @@ Ist diese nicht gesetzt. wird intern eine Anonymisierung der Patienten-ID vorgen
 * `APP_PSEUDONYMIZE_PREFIX`: Standortbezogenes Präfix - `UNKNOWN`, wenn nicht gesetzt
 * `APP_PSEUDONYMIZE_GENERATOR`: `BUILDIN` oder `GPAS` - `BUILDIN`, wenn nicht gesetzt
 
-**Hinweis**
+**Hinweise**: 
 
-Die Pseudonymisierung erfolgt im ETL-Prozessor nur für die Patienten-ID.
+* Der alte Konfigurationsparameter `APP_PSEUDONYMIZER` mit den Werten `GPAS` oder `BUILDIN` sollte nicht mehr verwendet
-Andere IDs werden mithilfe des standortbezogenen Präfixes (erneut) anonymisiert, um für den
+  werden.
-aktuellen Kontext nicht
+* Die Pseudonymisierung erfolgt im ETL-Prozessor nur für die Patienten-ID.
-vergleichbare IDs bereitzustellen.
+  Andere IDs werden mithilfe des standortbezogenen Präfixes (erneut) anonymisiert, um für den aktuellen Kontext nicht
+  vergleichbare IDs bereitzustellen.
 
 #### Eingebaute Anonymisierung
 
-Wurde keine oder die Verwendung der eingebauten Anonymisierung konfiguriert, so wird für die
+Wurde keine oder die Verwendung der eingebauten Anonymisierung konfiguriert, so wird für die Patienten-ID der
-Patienten-ID der
+entsprechende SHA-256-Hash gebildet und Base64-codiert - hier ohne endende "=" - zuzüglich des konfigurierten Präfixes
-entsprechende SHA-256-Hash gebildet und Base64-codiert - hier ohne endende "=" - zuzüglich des
-konfigurierten Präfixes
 als Patienten-Pseudonym verwendet.
 
 #### Pseudonymisierung mit gPAS
 
 Wurde die Verwendung von gPAS konfiguriert, so sind weitere Angaben zu konfigurieren.
 
-* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_URI`: URI der gPAS-Instanz inklusive Endpoint (z.B.
+* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_URI`: URI der gPAS-Instanz inklusive Endpoint (z.B. `http://localhost:8080/ttp-fhir/fhir/gpas/$$pseudonymizeAllowCreate`)
-  `http://localhost:8080/ttp-fhir/fhir/gpas/$$pseudonymizeAllowCreate`)
+* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_TARGET`: gPas Domänenname
-* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_TARGET`: gPas Domänenname für Patienten ID
 * `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_USERNAME`: gPas Basic-Auth Benutzername
 * `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_PASSWORD`: gPas Basic-Auth Passwort
-* `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_GENOM_DE_DOMAIN`: gPas Multi-Pseudonym-Domäne für genomDE Vorgangsnummern (
+* ~~`APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_SSLCALOCATION`~~: **Veraltet** - Root Zertifikat für gPas, falls es dediziert hinzugefügt werden muss.
-  Clinical data node)
+  **Wird in nach Version 0.10 entfernt**
+
+Der Konfigurationsparameter `APP_PSEUDONYMIZE_GPAS_SSLCALOCATION` sollte nicht mehr verwendet werden und wird nach
+Version 0.10 entfernt.
+Stattdessen sollte das Root Zertifikat wie unter [_Integration eines eigenen Root CA
+Zertifikats_](#integration-eines-eigenen-root-ca-zertifikats) beschrieben eingebunden werden.
 
 ### Anmeldung mit einem Passwort
 
-Ein initialer Administrator-Account kann optional konfiguriert werden und sorgt dafür, dass
+Ein initialer Administrator-Account kann optional konfiguriert werden und sorgt dafür, dass bestimmte Bereiche nur nach
-bestimmte Bereiche nur nach
 einem erfolgreichen Login erreichbar sind.
 
 * `APP_SECURITY_ADMIN_USER`: Muss angegeben werden zur Aktivierung der Zugriffsbeschränkung.
@@ -135,34 +114,27 @@ Hier Beispiele für das Beispielpasswort `very-secret`:
 * `{bcrypt}$2y$05$CCkfsMr/wbTleMyjVIK8g.Aa3RCvrvoLXVAsL.f6KeouS88vXD9b6`
 * `{sha256}9a34717f0646b5e9cfcba70055de62edb026ff4f68671ba3db96aa29297d2df5f1a037d58c745657`
 
-Wird kein Administrator-Passwort angegeben, wird ein zufälliger Wert generiert und beim Start der
+Wird kein Administrator-Passwort angegeben, wird ein zufälliger Wert generiert und beim Start der Anwendung in den Logs
-Anwendung in den Logs
 angezeigt.
 
 #### Weitere (nicht administrative) Nutzer mit OpenID Connect
 
-Die folgenden Konfigurationsparameter werden benötigt, um die Authentifizierung weiterer Benutzer an
+Die folgenden Konfigurationsparameter werden benötigt, um die Authentifizierung weiterer Benutzer an einen OIDC-Provider
-einen OIDC-Provider
 zu delegieren.
 Ein Admin-Benutzer muss dabei konfiguriert sein.
 
-* `APP_SECURITY_ENABLE_OIDC`: Aktiviert die Nutzung von OpenID Connect. Damit sind weitere Parameter
+* `APP_SECURITY_ENABLE_OIDC`: Aktiviert die Nutzung von OpenID Connect. Damit sind weitere Parameter erforderlich
-  erforderlich
+* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_NAME`: Name. Wird beim zusätzlichen Loginbutton angezeigt.
-* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_NAME`: Name. Wird beim zusätzlichen
-  Loginbutton angezeigt.
 * `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_ID`: Client-ID
 * `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_SECRET`: Client-Secret
-* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_SCOPE[0]`: Hier sollte immer `openid`
+* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_REGISTRATION_CUSTOM_CLIENT_SCOPE[0]`: Hier sollte immer `openid` angegeben werden.
-  angegeben werden.
 * `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_PROVIDER_CUSTOM_ISSUER_URI`: Die URI des Providers,
   z.B. `https://auth.example.com/realm/example`
-* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_PROVIDER_CUSTOM_USER_NAME_ATTRIBUTE`: Name des Attributes, welches
+* `SPRING_SECURITY_OAUTH2_CLIENT_PROVIDER_CUSTOM_USER_NAME_ATTRIBUTE`: Name des Attributes, welches den Benutzernamen
-  den Benutzernamen
   enthält.
   Oft verwendet: `preferred_username`
 
-Ist die Nutzung von OpenID Connect konfiguriert, erscheint ein zusätzlicher Login-Button zur Nutzung
+Ist die Nutzung von OpenID Connect konfiguriert, erscheint ein zusätzlicher Login-Button zur Nutzung mit OpenID Connect
-mit OpenID Connect
 und dem konfigurierten `CLIENT_NAME`.
 
 ![Login mit OpenID Connect](docs/login.png)
@@ -173,76 +145,62 @@ zu finden.
 
 #### Rollenbasierte Berechtigungen
 
-Wird OpenID Connect verwendet, gibt es eine rollenbasierte Berechtigungszuweisung.
+Wird OpenID Connect verwendet, gibt es eine rollenbasierte Berechtigungszuweisung. 
 
-Die Standardrolle für neue OIDC-Benutzer kann mit der Option `APP_SECURITY_DEFAULT_USER_ROLE`
+Die Standardrolle für neue OIDC-Benutzer kann mit der Option `APP_SECURITY_DEFAULT_USER_ROLE` festgelegt werden.
-festgelegt werden.
 Mögliche Werte sind `user` oder `guest`. Standardwert ist `user`.
 
 Benutzer mit der Rolle "Gast" sehen nur die Inhalte, die auch nicht angemeldete Benutzer sehen.
 
-Hierdurch ist es möglich, einzelne Benutzer einzuschränken oder durch Änderung der Standardrolle auf
+Hierdurch ist es möglich, einzelne Benutzer einzuschränken oder durch Änderung der Standardrolle auf `guest` nur
-`guest` nur
 einzelne Benutzer als vollwertige Nutzer zuzulassen.
 
 ![Rollenverwaltung](docs/userroles.png)
 
-Benutzer werden nach dem Entfernen oder der Änderung der vergebenen Rolle automatisch abgemeldet und
+Benutzer werden nach dem Entfernen oder der Änderung der vergebenen Rolle automatisch abgemeldet und müssen sich neu anmelden.
-müssen sich neu anmelden.
 Sie bekommen dabei wieder die Standardrolle zugewiesen.
 
 #### Auswirkungen auf den dargestellten Inhalt
 
-Nur Administratoren haben Zugriff auf den Konfigurationsbereich, nur angemeldete Benutzer können die
+Nur Administratoren haben Zugriff auf den Konfigurationsbereich, nur angemeldete Benutzer können die anonymisierte oder
-anonymisierte oder
 pseudonymisierte Patienten-ID sowie den Qualitätsbericht von DNPM:DIP einsehen.
 
 Wurde kein Administrator-Account konfiguriert, sind diese Inhalte generell nicht verfügbar.
 
 ### Tokenbasierte Authentifizierung für MTBFile-Endpunkt
 
-Die Anwendung unterstützt das Erstellen und Nutzen einer tokenbasierten Authentifizierung für den
+Die Anwendung unterstützt das Erstellen und Nutzen einer tokenbasierten Authentifizierung für den MTB-File-Endpunkt.
-MTB-File-Endpunkt.
 
-Dies kann mit der Umgebungsvariable `APP_SECURITY_ENABLE_TOKENS` aktiviert (`true` oder `false`)
+Dies kann mit der Umgebungsvariable `APP_SECURITY_ENABLE_TOKENS` aktiviert (`true` oder `false`) werden
-werden
 und ist als Standardeinstellung nicht aktiv.
 
-Ist diese Einstellung aktiviert worden, ist es Administratoren möglich, Zugriffstokens für Onkostar
+Ist diese Einstellung aktiviert worden, ist es Administratoren möglich, Zugriffstokens für Onkostar zu erstellen, die
-zu erstellen, die
 zur Nutzung des MTB-File-Endpunkts eine HTTP-Basic-Authentifizierung voraussetzen.
 
 ![Tokenverwaltung](docs/tokens.png)
 
-In diesem Fall kann der Endpunkt für das Onkostar-Plugin *
+In diesem Fall kann der Endpunkt für das Onkostar-Plugin **[onkostar-plugin-dnpmexport](https://github.com/CCC-MF/onkostar-plugin-dnpmexport)** wie folgt konfiguriert werden:
-*[onkostar-plugin-dnpmexport](https://github.com/CCC-MF/onkostar-plugin-dnpmexport)** wie folgt
-konfiguriert werden:
 
 ```
 https://testonkostar:MTg1NTL...NGU4@etl.example.com/mtbfile
 ```
 
-Ist die Verwendung von Tokens aktiv, werden Anfragen ohne die Angabe der Token-Information
+Ist die Verwendung von Tokens aktiv, werden Anfragen ohne die Angabe der Token-Information abgelehnt.
-abgelehnt.
 
 Alternativ kann eine Authentifizierung über Benutzername/Passwort oder OIDC erfolgen.
 
 ### Transformation von Werten
 
-In Onkostar kann es vorkommen, dass ein Wert eines Merkmalskatalogs an einem Standort angepasst
+In Onkostar kann es vorkommen, dass ein Wert eines Merkmalskatalogs an einem Standort angepasst wurde und dadurch nicht dem Wert entspricht,
-wurde und dadurch nicht dem Wert entspricht,
 der von DNPM:DIP akzeptiert wird.
 
-Diese Anwendung bietet daher die Möglichkeit, eine Transformation vorzunehmen. Hierzu muss der "
+Diese Anwendung bietet daher die Möglichkeit, eine Transformation vorzunehmen. Hierzu muss der "Pfad" innerhalb des JSON-MTB-Files angegeben werden und
-Pfad" innerhalb des JSON-MTB-Files angegeben werden und
 welcher Wert wie ersetzt werden soll.
 
 Hier ein Beispiel für die erste (Index 0 - weitere dann mit 1,2, ...) Transformationsregel:
 
-* `APP_TRANSFORMATIONS_0_PATH`: Pfad zum Wert in der JSON-MTB-Datei. Beispiel:
+* `APP_TRANSFORMATIONS_0_PATH`: Pfad zum Wert in der JSON-MTB-Datei. Beispiel: `diagnoses[*].icd10.version` für **alle** Diagnosen
-  `diagnoses[*].icd10.version` für **alle** Diagnosen
+* `APP_TRANSFORMATIONS_0_FROM`: Angabe des Werts, der ersetzt werden soll. Andere Werte bleiben dabei unverändert.
-* `APP_TRANSFORMATIONS_0_FROM`: Angabe des Werts, der ersetzt werden soll. Andere Werte bleiben
-  dabei unverändert.
 * `APP_TRANSFORMATIONS_0_TO`: Angabe des neuen Werts.
 
 ### Mögliche Endpunkte zur Datenübermittlung
@@ -257,61 +215,53 @@ Werden sowohl REST als auch Kafka-Endpunkt konfiguriert, wird nur der REST-Endpu
 Folgende Umgebungsvariablen müssen gesetzt sein, damit ein bwHC-MTB-File an DNPM:DIP gesendet wird:
 
 * `APP_REST_URI`: URI der zu benutzenden API der Backend-Instanz. Zum Beispiel:
-    * `http://localhost:9000/bwhc/etl/api` für **bwHC Backend**
+  * `http://localhost:9000/bwhc/etl/api` für **bwHC Backend**
-    * `http://localhost:9000/api` für **dnpm:dip**
+  * `http://localhost:9000/api` für **dnpm:dip**
 * `APP_REST_USERNAME`: Basic-Auth-Benutzername für den REST-Endpunkt
 * `APP_REST_PASSWORD`: Basic-Auth-Passwort für den REST-Endpunkt
 * `APP_REST_IS_BWHC`: `true` für **bwHC Backend**, weglassen oder `false` für **dnpm:dip**
 
 #### Kafka-Topics
 
-Folgende Umgebungsvariablen müssen gesetzt sein, damit ein bwHC-MTB-File an ein Kafka-Topic
+Folgende Umgebungsvariablen müssen gesetzt sein, damit ein bwHC-MTB-File an ein Kafka-Topic übermittelt wird:
-übermittelt wird:
 
-* `APP_KAFKA_OUTPUT_TOPIC`: Zu verwendendes Topic zum Versenden von Anfragen.
+* `APP_KAFKA_OUTPUT_TOPIC`: Zu verwendendes Topic zum Versenden von Anfragen. 
-* `APP_KAFKA_OUTPUT_RESPONSE_TOPIC`: Topic mit Antworten über den Erfolg des Versendens.
+  Ersetzt ~~`APP_KAFKA_TOPIC`~~, **welches nach Version 0.10 entfernt wird**. 
-  Standardwert: `APP_KAFKA_TOPIC` mit Anhang "_response".
+* `APP_KAFKA_OUTPUT_RESPONSE_TOPIC`: Topic mit Antworten über den Erfolg des Versendens. Standardwert: `APP_KAFKA_TOPIC` mit Anhang "_response".
-* `APP_KAFKA_GROUP_ID`: Kafka GroupID des Consumers. Standardwert: `APP_KAFKA_TOPIC` mit Anhang "_
+  Ersetzt ~~`APP_KAFKA_RESPONSE_TOPIC`~~, **welches nach Version 0.10 entfernt wird**.
-  group".
+* `APP_KAFKA_GROUP_ID`: Kafka GroupID des Consumers. Standardwert: `APP_KAFKA_TOPIC` mit Anhang "_group".
 * `APP_KAFKA_SERVERS`: Zu verwendende Kafka-Bootstrap-Server als kommagetrennte Liste
 
-Wird keine Rückantwort über Apache Kafka empfangen und es gibt keine weitere Möglichkeit den Status
+Wird keine Rückantwort über Apache Kafka empfangen und es gibt keine weitere Möglichkeit den Status festzustellen, verbleibt der Status auf `UNKNOWN`.
-festzustellen, verbleibt der Status auf `UNKNOWN`.
 
 Weitere Einstellungen können über die Parameter von Spring Kafka konfiguriert werden.
 
-Lässt sich keine Verbindung zu dem Backend aufbauen, wird eine Rückantwort mit Status-Code `900`
+Lässt sich keine Verbindung zu dem Backend aufbauen, wird eine Rückantwort mit Status-Code `900` erwartet, welchen es
-erwartet, welchen es
 für HTTP nicht gibt.
 
-Wird die Umgebungsvariable `APP_KAFKA_INPUT_TOPIC` gesetzt, kann eine Nachricht auch über dieses
+Wird die Umgebungsvariable `APP_KAFKA_INPUT_TOPIC` gesetzt, kann eine Nachricht auch über dieses Kafka-Topic an den ETL-Prozessor übermittelt werden.
-Kafka-Topic an den ETL-Prozessor übermittelt werden.
 
 ##### Retention Time
 
 Generell werden in Apache Kafka alle Records entsprechend der Konfiguration vorgehalten.
 So wird ohne spezielle Konfiguration ein Record für 7 Tage in Apache Kafka gespeichert.
-Es sind innerhalb dieses Zeitraums auch alte Informationen weiterhin enthalten, wenn der Consent
+Es sind innerhalb dieses Zeitraums auch alte Informationen weiterhin enthalten, wenn der Consent später abgelehnt wurde.
-später abgelehnt wurde.
 
 Durch eine entsprechende Konfiguration des Topics kann dies verhindert werden.
 
 Beispiel - auszuführen innerhalb des Kafka-Containers: Löschen alter Records nach einem Tag
-
 ```
 kafka-configs.sh --bootstrap-server localhost:9092 --alter --topic test --add-config retention.ms=86400000
 ```
 
 ##### Key based Retention
 
-Möchten Sie hingegen immer nur die letzte Meldung für einen Patienten und eine Erkrankung in Apache
+Möchten Sie hingegen immer nur die letzte Meldung für einen Patienten und eine Erkrankung in Apache Kafka vorhalten,
-Kafka vorhalten,
 so ist die nachfolgend genannte Konfiguration der Kafka-Topics hilfreich.
 
-* `retention.ms`: Möglichst kurze Zeit in der alte Records noch erhalten bleiben, z.B. 10 Sekunden
+
-  10000
+* `retention.ms`: Möglichst kurze Zeit in der alte Records noch erhalten bleiben, z.B. 10 Sekunden 10000
-* `cleanup.policy`: Löschen alter Records und Beibehalten des letzten Records zu einem
+* `cleanup.policy`: Löschen alter Records und Beibehalten des letzten Records zu einem Key [delete,compact]
-  Key [delete,compact]
 
 Beispiele für ein Topic `test`, hier bitte an die verwendeten Topics anpassen.
 
@@ -320,23 +270,17 @@ kafka-configs.sh --bootstrap-server localhost:9092 --alter --topic test --add-co
 kafka-configs.sh --bootstrap-server localhost:9092 --alter --topic test --add-config cleanup.policy=[delete,compact]
 ```
 
-Da als Key eines Records die (pseudonymisierte) Patienten-ID verwendet wird, stehen mit obiger
+Da als Key eines Records die (pseudonymisierte) Patienten-ID verwendet wird, stehen mit obiger Konfiguration 
-Konfiguration
+der Kafka-Topics nach 10 Sekunden nur noch der jeweils letzte Eintrag für den entsprechenden Key zur Verfügung.
-der Kafka-Topics nach 10 Sekunden nur noch der jeweils letzte Eintrag für den entsprechenden Key zur
-Verfügung.
 
-Da der Key sowohl für die Records in Richtung DNPM:DIP, als auch für die Rückantwort identisch
+Da der Key sowohl für die Records in Richtung DNPM:DIP, als auch für die Rückantwort identisch aufgebaut ist, lassen sich so
-aufgebaut ist, lassen sich so
+auch im Falle eines Consent-Widerspruchs die enthaltenen Daten als auch die Offenlegung durch Verifikationsdaten in der
-auch im Falle eines Consent-Widerspruchs die enthaltenen Daten als auch die Offenlegung durch
-Verifikationsdaten in der
 Antwort effektiv verhindern, da diese nach 10 Sekunden gelöscht werden.
 
-Es steht dann nur noch die jeweils letzten Information zur Verfügung, dass für einen Patienten/eine
+Es steht dann nur noch die jeweils letzten Information zur Verfügung, dass für einen Patienten/eine Erkrankung
-Erkrankung
 ein Consent-Widerspruch erfolgte.
 
-Dieses Vorgehen empfiehlt sich, wenn Sie gespeicherte Records nachgelagert für andere Auswertungen
+Dieses Vorgehen empfiehlt sich, wenn Sie gespeicherte Records nachgelagert für andere Auswertungen verwenden möchten.
-verwenden möchten.
 
 ### Antworten und Statusauswertung
 
@@ -348,12 +292,10 @@ Anfragen an das bwHC-Backend aus Versionen bis 0.9.x wurden wie folgt behandelt:
 | `HTTP 201`     | `WARNING` |
 | `HTTP 400-...` | `ERROR`   |
 
-Dies konnte dazu führen, dass zwar mit einem `HTTP 201` geantwortet wurde, aber dennoch in der
+Dies konnte dazu führen, dass zwar mit einem `HTTP 201` geantwortet wurde, aber dennoch in der Issue-Liste die
-Issue-Liste die
 Severity `error` aufgetaucht ist.
 
-Ab Version 0.10 wird die Issue-Liste der Antwort verwendet und die darion enthaltene höchste
+Ab Version 0.10 wird die Issue-Liste der Antwort verwendet und die darion enthaltene höchste Severity-Stufe als Ergebnis verwendet.
-Severity-Stufe als Ergebnis verwendet.
 
 | Höchste Severity | Status    |
 |------------------|-----------|
@@ -363,10 +305,9 @@ Severity-Stufe als Ergebnis verwendet.
 
 ## Docker-Images
 
-Diese Anwendung ist auch als Docker-Image
+Diese Anwendung ist auch als Docker-Image verfügbar: https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/pkgs/container/etl-processor
-verfügbar: https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/pkgs/container/etl-processor
 
-### Images lokal bauen
+### Images lokal bauen 
 
 ```bash
 ./gradlew bootBuildImage
@@ -374,25 +315,20 @@ verfügbar: https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/pkgs/container/etl-proces
 
 ### Integration eines eigenen Root CA Zertifikats
 
-Wird eine eigene Root CA verwendet, die nicht offiziell signiert ist, wird es zu Problemen beim
+Wird eine eigene Root CA verwendet, die nicht offiziell signiert ist, wird es zu Problemen beim SSL-Handshake kommen, wenn z.B. gPAS zur Generierung von Pseudonymen verwendet wird.
-SSL-Handshake kommen, wenn z.B. gPAS zur Generierung von Pseudonymen verwendet wird.
 
 Hier bietet es sich an, das Root CA Zertifikat in das Image zu integrieren.
 
 #### Integration beim Bauen des Images
 
-Hier muss die Zeile `"BP_EMBED_CERTS" to "true"` in der Datei `build.gradle.kts` verwendet werden
+Hier muss die Zeile `"BP_EMBED_CERTS" to "true"` in der Datei `build.gradle.kts` verwendet werden und darf nicht als Kommentar verwendet werden.
-und darf nicht als Kommentar verwendet werden.
 
-Die PEM-Datei mit dem/den Root CA Zertifikat(en) muss dabei im vorbereiteten Verzeichnis [
+Die PEM-Datei mit dem/den Root CA Zertifikat(en) muss dabei im vorbereiteten Verzeichnis [`bindings/ca-certificates`](bindings/ca-certificates) enthalten sein.
-`bindings/ca-certificates`](bindings/ca-certificates) enthalten sein.
 
 #### Integration zur Laufzeit
 
 Hier muss die Umgebungsvariable `SERVICE_BINDING_ROOT` z.B. auf den Wert `/bindings` gesetzt sein.
-Zudem muss ein Verzeichnis `bindings/ca-certificates` - analog zum Verzeichnis [
+Zudem muss ein Verzeichnis `bindings/ca-certificates` - analog zum Verzeichnis [`bindings/ca-certificates`](bindings/ca-certificates) mit einer PEM-Datei als Docker-Volume eingebunden werden.
-`bindings/ca-certificates`](bindings/ca-certificates) mit einer PEM-Datei als Docker-Volume
-eingebunden werden.
 
 Beispiel für Docker-Compose:
 
@@ -407,14 +343,12 @@ Beispiel für Docker-Compose:
 ```
 
 ## Deployment
-
 *Ausführen als Docker Container:*
 
 ```bash
 cd ./deploy
 cp env-sample.env .env
 ```
-
 Wenn gewünscht, Änderungen in der `.env` vornehmen.
 
 ```bash
@@ -423,19 +357,15 @@ docker compose up -d
 
 ### Einfaches Beispiel für ein eigenes Docker-Compose-File
 
-Die Datei [`docs/docker-compose.yml`](docs/docker-compose.yml) zeigt eine einfache Konfiguration für
+Die Datei [`docs/docker-compose.yml`](docs/docker-compose.yml) zeigt eine einfache Konfiguration für REST-Requests basierend 
-REST-Requests basierend
 auf Docker-Compose mit der gestartet werden kann.
 
 ### Betrieb hinter einem Reverse-Proxy
 
-Die Anwendung verarbeitet `X-Forwarded`-HTTP-Header und kann daher auch hinter einem Reverse-Proxy
+Die Anwendung verarbeitet `X-Forwarded`-HTTP-Header und kann daher auch hinter einem Reverse-Proxy betrieben werden.
-betrieben werden.
 
-Dabei werden, je nachdem welche Header durch den Reverse-Proxy gesendet werden auch Protokoll, Host
+Dabei werden, je nachdem welche Header durch den Reverse-Proxy gesendet werden auch Protokoll, Host oder auch Path-Präfix
-oder auch Path-Präfix
+automatisch erkannt und verwendet werden. Dadurch ist z.B. eine abweichende Angabe des Pfads problemlos möglich.
-automatisch erkannt und verwendet werden. Dadurch ist z.B. eine abweichende Angabe des Pfads
-problemlos möglich.
 
 #### Beispiel *Traefik* (mit Docker-Labels):
 
@@ -471,17 +401,13 @@ Das folgende Beispiel zeigt die Konfiguration einer _location_ in einer nginx-Ko
 
 ## Entwicklungssetup
 
-Zum Starten einer lokalen Entwicklungs- und Testumgebung kann die beiliegende Datei
+Zum Starten einer lokalen Entwicklungs- und Testumgebung kann die beiliegende Datei `dev-compose.yml` verwendet werden.
-`dev-compose.yml` verwendet werden.
 Diese kann zur Nutzung der Datenbanken **MariaDB** als auch **PostgreSQL** angepasst werden.
 
-Zur Nutzung von Apache Kafka muss dazu ein Eintrag im hosts-File vorgenommen werden und der Hostname
+Zur Nutzung von Apache Kafka muss dazu ein Eintrag im hosts-File vorgenommen werden und der Hostname `kafka` auf die lokale
-`kafka` auf die lokale
+IP-Adresse verweisen. Ohne diese Einstellung ist eine Nutzung von Apache Kafka außerhalb der Docker-Umgebung nicht möglich.
-IP-Adresse verweisen. Ohne diese Einstellung ist eine Nutzung von Apache Kafka außerhalb der
-Docker-Umgebung nicht möglich.
 
-Beim Start der Anwendung mit dem Profil `dev` wird die in `dev-compose.yml` definierte Umgebung beim
+Beim Start der Anwendung mit dem Profil `dev` wird die in `dev-compose.yml` definierte Umgebung beim Start der
-Start der
 Anwendung mit gestartet:
 
 ```
@@ -493,5 +419,4 @@ Die Datei `application-dev.yml` enthält hierzu die Konfiguration für das Profi
 Beim Ausführen der Integrationstests wird eine Testdatenbank in einem Docker-Container gestartet.
 Siehe hier auch die Klasse `AbstractTestcontainerTest` unter `src/integrationTest`.
 
-Ein einfaches Entwickler-Setup inklusive DNPM:DIP ist mit Hilfe
+Ein einfaches Entwickler-Setup inklusive DNPM:DIP ist mit Hilfe von https://github.com/pcvolkmer/dnpmdip-devenv realisierbar.
-von https://github.com/pcvolkmer/dnpmdip-devenv realisierbar.

build.gradle.kts

@@ -5,7 +5,7 @@ import org.springframework.boot.gradle.tasks.bundling.BootBuildImage
 
 plugins {
     war
-    id("org.springframework.boot") version "3.5.3"
+    id("org.springframework.boot") version "3.3.10"
     id("io.spring.dependency-management") version "1.1.7"
     kotlin("jvm") version "1.9.25"
     kotlin("plugin.spring") version "1.9.25"
@@ -13,12 +13,12 @@ plugins {
 }
 
 group = "dev.dnpm"
-version = "0.11.0-SNAPSHOT"
+version = "0.10.0"
 
 var versions = mapOf(
     "bwhc-dto-java" to "0.4.0",
-    "mtb-dto" to "0.1.0-SNAPSHOT",
     "hapi-fhir" to "7.6.0",
+    "commons-compress" to "1.26.2",
     "mockito-kotlin" to "5.4.0",
     "archunit" to "1.3.0",
     // Webjars
@@ -49,18 +49,9 @@ configurations {
     compileOnly {
         extendsFrom(configurations.annotationProcessor.get())
     }
-
-    all {
-        resolutionStrategy {
-            cacheChangingModulesFor(5, "minutes")
-        }
-    }
 }
 
 repositories {
-    maven {
-        url = uri("https://git.dnpm.dev/api/packages/public-snapshots/maven")
-    }
     maven {
         url = uri("https://git.dnpm.dev/api/packages/public/maven")
     }
@@ -82,7 +73,6 @@ dependencies {
     implementation("commons-codec:commons-codec")
     implementation("io.projectreactor.kotlin:reactor-kotlin-extensions")
     implementation("de.ukw.ccc:bwhc-dto-java:${versions["bwhc-dto-java"]}")
-    implementation("dev.pcvolkmer.mv64e:mtb-dto:${versions["mtb-dto"]}") { isChanging = true }
     implementation("ca.uhn.hapi.fhir:hapi-fhir-base:${versions["hapi-fhir"]}")
     implementation("ca.uhn.hapi.fhir:hapi-fhir-structures-r4:${versions["hapi-fhir"]}")
     implementation("org.apache.httpcomponents.client5:httpclient5")
@@ -90,7 +80,6 @@ dependencies {
     implementation("org.webjars:webjars-locator:${versions["webjars-locator"]}")
     implementation("org.webjars.npm:echarts:${versions["echarts"]}")
     implementation("org.webjars.npm:htmx.org:${versions["htmx.org"]}")
-    implementation ("org.apache.commons:commons-math3:3.6.1")
 
     runtimeOnly("org.mariadb.jdbc:mariadb-java-client")
     runtimeOnly("org.postgresql:postgresql")
@@ -110,8 +99,10 @@ dependencies {
     integrationTestImplementation("org.testcontainers:junit-jupiter")
     integrationTestImplementation("org.testcontainers:postgresql")
     integrationTestImplementation("com.tngtech.archunit:archunit:${versions["archunit"]}")
-    integrationTestImplementation("org.htmlunit:htmlunit")
+    integrationTestImplementation("net.sourceforge.htmlunit:htmlunit")
     integrationTestImplementation("org.springframework:spring-webflux")
+    // Override dependency version from org.testcontainers:junit-jupiter - CVE-2024-26308, CVE-2024-25710
+    integrationTestImplementation("org.apache.commons:commons-compress:${versions["commons-compress"]}")
 }
 
 tasks.withType<KotlinCompile> {
@@ -128,9 +119,8 @@ tasks.withType<Test> {
     }
 }
 
-tasks.register<Test>("integrationTest") {
+task<Test>("integrationTest") {
     description = "Runs integration tests"
-    group = "verification"
 
     testClassesDirs = sourceSets["integrationTest"].output.classesDirs
     classpath = sourceSets["integrationTest"].runtimeClasspath

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/EtlProcessorApplicationTests.kt

@@ -23,7 +23,6 @@ import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestRepository
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
-import dev.dnpm.etl.processor.output.BwhcV1MtbFileRequest
 import dev.dnpm.etl.processor.output.MtbFileSender
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
@@ -34,10 +33,10 @@ import org.mockito.kotlin.*
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.AutoConfigureMockMvc
 import org.springframework.boot.test.context.SpringBootTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.context.ApplicationContext
 import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
 import org.springframework.test.web.servlet.post
@@ -46,7 +45,7 @@ import org.testcontainers.junit.jupiter.Testcontainers
 @Testcontainers
 @ExtendWith(SpringExtension::class)
 @SpringBootTest
-@MockitoBean(types = [MtbFileSender::class])
+@MockBean(MtbFileSender::class)
 @TestPropertySource(
     properties = [
         "app.rest.uri=http://example.com",
@@ -74,7 +73,7 @@ class EtlProcessorApplicationTests : AbstractTestcontainerTest() {
     )
     inner class TransformationTest {
 
-        @MockitoBean
+        @MockBean
         private lateinit var mtbFileSender: MtbFileSender
 
         @Autowired
@@ -92,7 +91,7 @@ class EtlProcessorApplicationTests : AbstractTestcontainerTest() {
         fun mtbFileIsTransformed() {
             doAnswer {
                 MtbFileSender.Response(RequestStatus.SUCCESS)
-            }.whenever(mtbFileSender).send(any<BwhcV1MtbFileRequest>())
+            }.whenever(mtbFileSender).send(any<MtbFileSender.MtbFileRequest>())
 
             val mtbFile = MtbFile.builder()
                 .withPatient(
@@ -135,9 +134,9 @@ class EtlProcessorApplicationTests : AbstractTestcontainerTest() {
                 }
             }
 
-            val captor = argumentCaptor<BwhcV1MtbFileRequest>()
+            val captor = argumentCaptor<MtbFileSender.MtbFileRequest>()
             verify(mtbFileSender).send(captor.capture())
-            assertThat(captor.firstValue.content.diagnoses).hasSize(1).allMatch { diagnosis ->
+            assertThat(captor.firstValue.mtbFile.diagnoses).hasSize(1).allMatch { diagnosis ->
                 diagnosis.icd10.version == "2014"
             }
         }

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/config/AppConfigurationTest.kt

@@ -26,9 +26,9 @@ import dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.output.RestMtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.AnonymizingGenerator
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.GpasPseudonymGenerator
+import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
 import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenRepository
 import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenService
-import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
@@ -36,25 +36,24 @@ import org.junit.jupiter.api.assertThrows
 import org.springframework.beans.factory.NoSuchBeanDefinitionException
 import org.springframework.boot.autoconfigure.kafka.KafkaAutoConfiguration
 import org.springframework.boot.test.context.SpringBootTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBeans
 import org.springframework.context.ApplicationContext
 import org.springframework.retry.support.RetryTemplate
 import org.springframework.security.crypto.password.PasswordEncoder
 import org.springframework.security.provisioning.InMemoryUserDetailsManager
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 
 @SpringBootTest
-@ContextConfiguration(
+@ContextConfiguration(classes = [
-    classes = [
+    AppConfiguration::class,
-        AppConfiguration::class,
+    AppSecurityConfiguration::class,
-        AppSecurityConfiguration::class,
+    KafkaAutoConfiguration::class,
-        KafkaAutoConfiguration::class,
+    AppKafkaConfiguration::class,
-        AppKafkaConfiguration::class,
+    AppRestConfiguration::class
-        AppRestConfiguration::class
+])
-    ]
+@MockBean(ObjectMapper::class)
-)
-@MockitoBean(types = [ObjectMapper::class])
 @TestPropertySource(
     properties = [
         "app.pseudonymize.generator=BUILDIN",
@@ -87,7 +86,7 @@ class AppConfigurationTest {
             "app.kafka.group-id=test"
         ]
     )
-    @MockitoBean(types = [RequestRepository::class])
+    @MockBean(RequestRepository::class)
     inner class AppConfigurationKafkaTest(private val context: ApplicationContext) {
 
         @Test
@@ -146,7 +145,7 @@ class AppConfigurationTest {
             "app.kafka.group-id=test"
         ]
     )
-    @MockitoBean(types = [RequestProcessor::class])
+    @MockBean(RequestProcessor::class)
     inner class AppConfigurationUsingKafkaInputTest(private val context: ApplicationContext) {
 
         @Test
@@ -182,7 +181,40 @@ class AppConfigurationTest {
         @Nested
         @TestPropertySource(
             properties = [
-                "app.pseudonymize.generator=buildin"
+                "app.pseudonymize.generator=",
+                "app.pseudonymizer=buildin",
+            ]
+        )
+        inner class AppConfigurationPseudonymizerBuildinTest(private val context: ApplicationContext) {
+
+            @Test
+            fun shouldUseConfiguredGenerator() {
+                assertThat(context.getBean(AnonymizingGenerator::class.java)).isNotNull
+            }
+
+        }
+
+        @Nested
+        @TestPropertySource(
+            properties = [
+                "app.pseudonymize.generator=",
+                "app.pseudonymizer=gpas",
+            ]
+        )
+        inner class AppConfigurationPseudonymizerGpasTest(private val context: ApplicationContext) {
+
+            @Test
+            fun shouldUseConfiguredGenerator() {
+                assertThat(context.getBean(GpasPseudonymGenerator::class.java)).isNotNull
+            }
+
+        }
+
+        @Nested
+        @TestPropertySource(
+            properties = [
+                "app.pseudonymize.generator=buildin",
+                "app.pseudonymizer=",
             ]
         )
         inner class AppConfigurationPseudonymizeGeneratorBuildinTest(private val context: ApplicationContext) {
@@ -197,7 +229,8 @@ class AppConfigurationTest {
         @Nested
         @TestPropertySource(
             properties = [
-                "app.pseudonymize.generator=gpas"
+                "app.pseudonymize.generator=gpas",
+                "app.pseudonymizer=",
             ]
         )
         inner class AppConfigurationPseudonymizeGeneratorGpasTest(private val context: ApplicationContext) {
@@ -215,13 +248,11 @@ class AppConfigurationTest {
                 "app.security.enable-tokens=true"
             ]
         )
-        @MockitoBean(
+        @MockBeans(value = [
-            types = [
+            MockBean(InMemoryUserDetailsManager::class),
-                InMemoryUserDetailsManager::class,
+            MockBean(PasswordEncoder::class),
-                PasswordEncoder::class,
+            MockBean(TokenRepository::class)
-                TokenRepository::class
+        ])
-            ]
-        )
         inner class AppConfigurationTokenEnabledTest(private val context: ApplicationContext) {
 
             @Test
@@ -232,13 +263,11 @@ class AppConfigurationTest {
         }
 
         @Nested
-        @MockitoBean(
+        @MockBeans(value = [
-            types = [
+            MockBean(InMemoryUserDetailsManager::class),
-                InMemoryUserDetailsManager::class,
+            MockBean(PasswordEncoder::class),
-                PasswordEncoder::class,
+            MockBean(TokenRepository::class)
-                TokenRepository::class
+        ])
-            ]
-        )
         inner class AppConfigurationTokenDisabledTest(private val context: ApplicationContext) {
 
             @Test

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/input/MtbFileRestControllerTest.kt

@@ -37,13 +37,13 @@ import org.mockito.kotlin.times
 import org.mockito.kotlin.verify
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.WebMvcTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.security.oauth2.client.registration.ClientRegistrationRepository
 import org.springframework.security.test.web.servlet.request.SecurityMockMvcRequestPostProcessors.anonymous
 import org.springframework.security.test.web.servlet.request.SecurityMockMvcRequestPostProcessors.user
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
 import org.springframework.test.web.servlet.delete
@@ -57,7 +57,7 @@ import org.springframework.test.web.servlet.post
         AppSecurityConfiguration::class
     ]
 )
-@MockitoBean(types = [TokenRepository::class, RequestProcessor::class])
+@MockBean(TokenRepository::class, RequestProcessor::class)
 @TestPropertySource(
     properties = [
         "app.pseudonymize.generator=BUILDIN",
@@ -91,7 +91,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
             status { isAccepted() }
         }
 
-        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
     }
 
     @Test
@@ -104,7 +104,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
             status { isAccepted() }
         }
 
-        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
     }
 
     @Test
@@ -117,7 +117,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
             status { isUnauthorized() }
         }
 
-        verify(requestProcessor, never()).processMtbFile(any<MtbFile>())
+        verify(requestProcessor, never()).processMtbFile(any())
     }
 
     @Test
@@ -130,7 +130,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
             status { isForbidden() }
         }
 
-        verify(requestProcessor, never()).processMtbFile(any<MtbFile>())
+        verify(requestProcessor, never()).processMtbFile(any())
     }
 
     @Test
@@ -156,7 +156,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
     }
 
     @Nested
-    @MockitoBean(types = [UserRoleRepository::class, ClientRegistrationRepository::class])
+    @MockBean(UserRoleRepository::class, ClientRegistrationRepository::class)
     @TestPropertySource(
         properties = [
             "app.pseudonymize.generator=BUILDIN",
@@ -177,7 +177,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
                 status { isAccepted() }
             }
 
-            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
         }
 
         @Test
@@ -190,7 +190,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
                 status { isAccepted() }
             }
 
-            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
         }
     }
 

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/monitoring/RequestRepositoryTest.kt

@@ -27,8 +27,8 @@ import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.data.jdbc.DataJdbcTest
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.jdbc.AutoConfigureTestDatabase
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.transaction.annotation.Transactional
 import org.testcontainers.junit.jupiter.Testcontainers
@@ -39,7 +39,7 @@ import java.time.Instant
 @DataJdbcTest
 @AutoConfigureTestDatabase(replace = AutoConfigureTestDatabase.Replace.NONE)
 @Transactional
-@MockitoBean(types = [MtbFileSender::class])
+@MockBean(MtbFileSender::class)
 @TestPropertySource(
     properties = [
         "app.pseudonymize.generator=buildin",

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/GpasPseudonymGeneratorTest.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -47,8 +47,9 @@ class GpasPseudonymGeneratorTest {
     fun setup() {
         val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
         val gPasConfigProperties = GPasConfigProperties(
-            "https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate",
+            "http://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate",
-            "test", "test2",
+            "test",
+            null,
             null,
             null
         )
@@ -62,15 +63,9 @@ class GpasPseudonymGeneratorTest {
     fun shouldReturnExpectedPseudonym() {
         this.mockRestServiceServer.expect {
             method(HttpMethod.POST)
-            requestTo("https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
+            requestTo("http://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
         }.andRespond {
-            withStatus(HttpStatus.OK).body(
+            withStatus(HttpStatus.OK).body(getDummyResponseBody("1234", "test", "test1234ABCDEF567890"))
-                getDummyResponseBody(
-                    "1234",
-                    "test",
-                    "test1234ABCDEF567890"
-                )
-            )
                 .createResponse(it)
         }
 
@@ -81,7 +76,7 @@ class GpasPseudonymGeneratorTest {
     fun shouldThrowExceptionIfGpasNotAvailable() {
         this.mockRestServiceServer.expect {
             method(HttpMethod.POST)
-            requestTo("https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
+            requestTo("http://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
         }.andRespond {
             withException(IOException("Simulated IO error")).createResponse(it)
         }
@@ -93,13 +88,10 @@ class GpasPseudonymGeneratorTest {
     fun shouldThrowExceptionIfGpasDoesNotReturn2xxResponse() {
         this.mockRestServiceServer.expect {
             method(HttpMethod.POST)
-            requestTo("https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
+            requestTo("http://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
         }.andRespond {
             withStatus(HttpStatus.FOUND)
-                .header(
+                .header(HttpHeaders.LOCATION, "https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate")
-                    HttpHeaders.LOCATION,
-                    "https://localhost/ttp-fhir/fhir/gpas/\$pseudonymizeAllowCreate"
-                )
                 .createResponse(it)
         }
 

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/services/RequestServiceIntegrationTest.kt

@@ -31,8 +31,8 @@ import org.junit.jupiter.api.Test
 import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.context.SpringBootTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.transaction.annotation.Transactional
 import org.testcontainers.junit.jupiter.Testcontainers
@@ -42,7 +42,7 @@ import java.time.Instant
 @ExtendWith(SpringExtension::class)
 @SpringBootTest
 @Transactional
-@MockitoBean(types = [MtbFileSender::class])
+@MockBean(MtbFileSender::class)
 @TestPropertySource(
     properties = [
         "app.pseudonymize.generator=buildin",

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/web/ConfigControllerTest.kt

@@ -19,6 +19,8 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.web
 
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.WebClient
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.html.HtmlPage
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppSecurityConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.ConnectionCheckResult
@@ -27,13 +29,11 @@ import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RestConnectionCheckService
 import dev.dnpm.etl.processor.output.MtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.Generator
 import dev.dnpm.etl.processor.security.Role
-import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenService
-import dev.dnpm.etl.processor.security.UserRoleService
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
+import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenService
 import dev.dnpm.etl.processor.services.TransformationService
+import dev.dnpm.etl.processor.security.UserRoleService
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
-import org.htmlunit.WebClient
-import org.htmlunit.html.HtmlPage
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
@@ -46,6 +46,7 @@ import org.mockito.kotlin.verify
 import org.mockito.kotlin.whenever
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.WebMvcTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.http.HttpHeaders
 import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.http.MediaType.TEXT_EVENT_STREAM
@@ -54,7 +55,6 @@ import org.springframework.security.test.web.servlet.request.SecurityMockMvcRequ
 import org.springframework.security.test.web.servlet.request.SecurityMockMvcRequestPostProcessors.user
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.reactive.server.WebTestClient
 import org.springframework.test.web.servlet.*
@@ -81,16 +81,14 @@ abstract class MockSink : Sinks.Many<Boolean>
         "app.pseudonymize.generator=BUILDIN"
     ]
 )
-@MockitoBean(name = "configsUpdateProducer", types = [MockSink::class])
+@MockBean(name = "configsUpdateProducer", classes = [MockSink::class])
-@MockitoBean(
+@MockBean(
-    types = [
+    Generator::class,
-        Generator::class,
+    MtbFileSender::class,
-        MtbFileSender::class,
+    RequestProcessor::class,
-        RequestProcessor::class,
+    TransformationService::class,
-        TransformationService::class,
+    GPasConnectionCheckService::class,
-        GPasConnectionCheckService::class,
+    RestConnectionCheckService::class,
-        RestConnectionCheckService::class
-    ]
 )
 class ConfigControllerTest {
 
@@ -145,10 +143,8 @@ class ConfigControllerTest {
             "app.security.admin-user=admin"
         ]
     )
-    @MockitoBean(
+    @MockBean(
-        types = [
+        TokenService::class
-            TokenService::class
-        ]
     )
     inner class WithTokensEnabled {
         private lateinit var tokenService: TokenService
@@ -256,10 +252,8 @@ class ConfigControllerTest {
             "app.security.admin-password={noop}very-secret"
         ]
     )
-    @MockitoBean(
+    @MockBean(
-        types = [
+        UserRoleService::class
-            UserRoleService::class
-        ]
     )
     inner class WithUserRolesEnabled {
         private lateinit var userRoleService: UserRoleService

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/web/HomeControllerTest.kt

@@ -19,6 +19,8 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.web
 
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.WebClient
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.html.HtmlPage
 import dev.dnpm.etl.processor.*
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppSecurityConfiguration
@@ -28,8 +30,6 @@ import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestType
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestService
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
-import org.htmlunit.WebClient
-import org.htmlunit.html.HtmlPage
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
@@ -40,13 +40,13 @@ import org.mockito.kotlin.any
 import org.mockito.kotlin.whenever
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.WebMvcTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.data.domain.Page
 import org.springframework.data.domain.PageImpl
 import org.springframework.data.domain.Pageable
 import org.springframework.security.test.context.support.WithMockUser
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
 import org.springframework.test.web.servlet.get
@@ -71,8 +71,8 @@ import java.util.*
         "app.security.admin-password={noop}very-secret"
     ]
 )
-@MockitoBean(
+@MockBean(
-    types = [RequestService::class]
+    RequestService::class
 )
 class HomeControllerTest {
 

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/web/LoginControllerTest.kt

@@ -19,21 +19,21 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.web
 
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.WebClient
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.html.HtmlPage
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppSecurityConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenService
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
-import org.htmlunit.WebClient
-import org.htmlunit.html.HtmlPage
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Test
 import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith
 import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.WebMvcTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
 import org.springframework.test.web.servlet.get
@@ -56,8 +56,8 @@ import org.springframework.test.web.servlet.htmlunit.MockMvcWebClientBuilder
         "app.security.enable-tokens=true"
     ]
 )
-@MockitoBean(
+@MockBean(
-    types = [TokenService::class]
+    TokenService::class,
 )
 class LoginControllerTest {
 

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/web/StatisticsControllerTest.kt

@@ -19,9 +19,9 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.web
 
+import com.gargoylesoftware.htmlunit.WebClient
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppSecurityConfiguration
-import org.htmlunit.WebClient
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Test
 import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith

src/integrationTest/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/web/StatisticsRestControllerTest.kt

@@ -41,10 +41,10 @@ import org.mockito.kotlin.doAnswer
 import org.mockito.kotlin.whenever
 import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired
 import org.springframework.boot.test.autoconfigure.web.servlet.WebMvcTest
+import org.springframework.boot.test.mock.mockito.MockBean
 import org.springframework.http.MediaType.TEXT_EVENT_STREAM
 import org.springframework.test.context.ContextConfiguration
 import org.springframework.test.context.TestPropertySource
-import org.springframework.test.context.bean.override.mockito.MockitoBean
 import org.springframework.test.context.junit.jupiter.SpringExtension
 import org.springframework.test.web.reactive.server.WebTestClient
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
@@ -74,8 +74,8 @@ import java.time.temporal.ChronoUnit
         "app.security.admin-password={noop}very-secret"
     ]
 )
-@MockitoBean(
+@MockBean(
-    types = [RequestService::class]
+    RequestService::class
 )
 class StatisticsRestControllerTest {
 

src/main/java/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/Generator.java

@@ -23,6 +23,4 @@ public interface Generator {
 
     String generate(String id);
 
-    String generateGenomDeTan(String id);
-
 }

src/main/java/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/GpasPseudonymGenerator.java

@@ -38,41 +38,30 @@ public class GpasPseudonymGenerator implements Generator {
 
     private final static FhirContext r4Context = FhirContext.forR4();
     private final String gPasUrl;
+    private final String psnTargetDomain;
     private final HttpHeaders httpHeader;
     private final RetryTemplate retryTemplate;
     private final Logger log = LoggerFactory.getLogger(GpasPseudonymGenerator.class);
-    private final RestTemplate restTemplate;
-    private final @NotNull String genomDeDomain;
-    private final @NotNull String psnTargetDomain;
 
-    public GpasPseudonymGenerator(GPasConfigProperties gpasCfg, RetryTemplate retryTemplate,
+    private final RestTemplate restTemplate;
-        RestTemplate restTemplate) {
+
+    public GpasPseudonymGenerator(GPasConfigProperties gpasCfg, RetryTemplate retryTemplate, RestTemplate restTemplate) {
         this.retryTemplate = retryTemplate;
         this.restTemplate = restTemplate;
         this.gPasUrl = gpasCfg.getUri();
         this.psnTargetDomain = gpasCfg.getTarget();
-        this.genomDeDomain = gpasCfg.getGenomDeDomain();
         httpHeader = getHttpHeaders(gpasCfg.getUsername(), gpasCfg.getPassword());
 
-        log.debug("{} has been initialized", this.getClass().getName());
+        log.debug(String.format("%s has been initialized", this.getClass().getName()));
 
     }
 
     @Override
     public String generate(String id) {
-        return generate(id, psnTargetDomain);
+        var gPasRequestBody = getGpasRequestBody(id);
-    }
-
-    @Override
-    public String generateGenomDeTan(String id) {
-        return generate(id, genomDeDomain);
-    }
-
-    protected String generate(String id, String targetDomain) {
-        var gPasRequestBody = getGpasRequestBody(id, targetDomain);
         var responseEntity = getGpasPseudonym(gPasRequestBody);
         var gPasPseudonymResult = (Parameters) r4Context.newJsonParser()
-            .parseResource(responseEntity.getBody());
+                .parseResource(responseEntity.getBody());
 
         return unwrapPseudonym(gPasPseudonymResult);
     }
@@ -86,9 +75,9 @@ public class GpasPseudonymGenerator implements Generator {
         }
 
         final var identifier = (Identifier) parameters.get().getPart().stream()
-            .filter(a -> a.getName().equals("pseudonym"))
+                .filter(a -> a.getName().equals("pseudonym"))
-            .findFirst()
+                .findFirst()
-            .orElseGet(ParametersParameterComponent::new).getValue();
+                .orElseGet(ParametersParameterComponent::new).getValue();
 
         // pseudonym
         return sanitizeValue(identifier.getValue());
@@ -117,8 +106,8 @@ public class GpasPseudonymGenerator implements Generator {
 
         try {
             responseEntity = retryTemplate.execute(
-                ctx -> restTemplate.exchange(gPasUrl, HttpMethod.POST, requestEntity,
+                    ctx -> restTemplate.exchange(gPasUrl, HttpMethod.POST, requestEntity,
-                    String.class));
+                            String.class));
 
             if (responseEntity.getStatusCode().is2xxSuccessful()) {
                 log.debug("API request succeeded. Response: {}", responseEntity.getStatusCode());
@@ -130,16 +119,16 @@ public class GpasPseudonymGenerator implements Generator {
             return responseEntity;
         } catch (Exception unexpected) {
             throw new PseudonymRequestFailed(
-                "API request due unexpected error unsuccessful gPas unsuccessful.", unexpected);
+                    "API request due unexpected error unsuccessful gPas unsuccessful.", unexpected);
         }
     }
 
-    protected String getGpasRequestBody(String id, String targetDomain) {
+    protected String getGpasRequestBody(String id) {
         var requestParameters = new Parameters();
         requestParameters.addParameter().setName("target")
-            .setValue(new StringType().setValue(targetDomain));
+                .setValue(new StringType().setValue(psnTargetDomain));
         requestParameters.addParameter().setName("original")
-            .setValue(new StringType().setValue(id));
+                .setValue(new StringType().setValue(id));
         final IParser iParser = r4Context.newJsonParser();
         return iParser.encodeResourceToString(requestParameters);
     }

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/config/AppConfigProperties.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -21,10 +21,16 @@ package dev.dnpm.etl.processor.config
 
 import dev.dnpm.etl.processor.security.Role
 import org.springframework.boot.context.properties.ConfigurationProperties
+import org.springframework.boot.context.properties.DeprecatedConfigurationProperty
 
 @ConfigurationProperties(AppConfigProperties.NAME)
 data class AppConfigProperties(
     var bwhcUri: String?,
+    @get:DeprecatedConfigurationProperty(
+        reason = "Deprecated in favor of 'app.pseudonymize.generator'",
+        replacement = "app.pseudonymize.generator"
+    )
+    var pseudonymizer: PseudonymGenerator = PseudonymGenerator.BUILDIN,
     var transformations: List<TransformationProperties> = listOf(),
     var maxRetryAttempts: Int = 3,
     var duplicationDetection: Boolean = true
@@ -48,9 +54,12 @@ data class PseudonymizeConfigProperties(
 data class GPasConfigProperties(
     val uri: String?,
     val target: String = "etl-processor",
-    val genomDeDomain: String = "ccdn",
     val username: String?,
     val password: String?,
+    @get:DeprecatedConfigurationProperty(
+        reason = "Deprecated in favor of including Root CA"
+    )
+    val sslCaLocation: String?
 ) {
     companion object {
         const val NAME = "app.pseudonymize.gpas"
@@ -73,8 +82,18 @@ data class RestTargetProperties(
 data class KafkaProperties(
     val inputTopic: String?,
     val outputTopic: String = "etl-processor",
+    @get:DeprecatedConfigurationProperty(
+        reason = "Deprecated",
+        replacement = "outputTopic"
+    )
+    val topic: String = outputTopic,
     val outputResponseTopic: String = "${outputTopic}_response",
-    val groupId: String = "${outputTopic}_group",
+    @get:DeprecatedConfigurationProperty(
+        reason = "Deprecated",
+        replacement = "outputResponseTopic"
+    )
+    val responseTopic: String = outputResponseTopic,
+    val groupId: String = "${topic}_group",
     val servers: String = ""
 ) {
     companion object {

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/config/AppConfiguration.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -32,6 +32,12 @@ import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenRepository
 import dev.dnpm.etl.processor.security.TokenService
 import dev.dnpm.etl.processor.services.Transformation
 import dev.dnpm.etl.processor.services.TransformationService
+import org.apache.hc.client5.http.impl.classic.HttpClients
+import org.apache.hc.client5.http.impl.io.BasicHttpClientConnectionManager
+import org.apache.hc.client5.http.socket.ConnectionSocketFactory
+import org.apache.hc.client5.http.socket.PlainConnectionSocketFactory
+import org.apache.hc.client5.http.ssl.SSLConnectionSocketFactory
+import org.apache.hc.core5.http.config.RegistryBuilder
 import org.slf4j.LoggerFactory
 import org.springframework.boot.autoconfigure.condition.ConditionalOnMissingBean
 import org.springframework.boot.autoconfigure.condition.ConditionalOnProperty
@@ -39,6 +45,7 @@ import org.springframework.boot.context.properties.EnableConfigurationProperties
 import org.springframework.context.annotation.Bean
 import org.springframework.context.annotation.Configuration
 import org.springframework.data.jdbc.repository.config.AbstractJdbcConfiguration
+import org.springframework.http.client.HttpComponentsClientHttpRequestFactory
 import org.springframework.retry.RetryCallback
 import org.springframework.retry.RetryContext
 import org.springframework.retry.RetryListener
@@ -51,6 +58,13 @@ import org.springframework.security.provisioning.InMemoryUserDetailsManager
 import org.springframework.web.client.HttpClientErrorException
 import org.springframework.web.client.RestTemplate
 import reactor.core.publisher.Sinks
+import java.io.BufferedInputStream
+import java.io.FileInputStream
+import java.security.KeyStore
+import java.security.cert.CertificateFactory
+import java.security.cert.X509Certificate
+import javax.net.ssl.SSLContext
+import javax.net.ssl.TrustManagerFactory
 import kotlin.time.Duration.Companion.seconds
 import kotlin.time.toJavaDuration
 
@@ -76,6 +90,18 @@ class AppConfiguration {
     @ConditionalOnProperty(value = ["app.pseudonymize.generator"], havingValue = "GPAS")
     @Bean
     fun gpasPseudonymGenerator(configProperties: GPasConfigProperties, retryTemplate: RetryTemplate, restTemplate: RestTemplate): Generator {
+        try {
+            if (!configProperties.sslCaLocation.isNullOrBlank()) {
+                return GpasPseudonymGenerator(
+                    configProperties,
+                    retryTemplate,
+                    createCustomGpasRestTemplate(configProperties)
+                )
+            }
+        } catch (e: Exception) {
+            throw RuntimeException(e)
+        }
+
         return GpasPseudonymGenerator(configProperties, retryTemplate, restTemplate)
     }
 
@@ -85,6 +111,92 @@ class AppConfiguration {
         return AnonymizingGenerator()
     }
 
+    @ConditionalOnProperty(value = ["app.pseudonymizer"], havingValue = "GPAS")
+    @ConditionalOnMissingBean
+    @Bean
+    fun gpasPseudonymGeneratorOnDeprecatedProperty(configProperties: GPasConfigProperties, retryTemplate: RetryTemplate, restTemplate: RestTemplate): Generator {
+        try {
+            if (!configProperties.sslCaLocation.isNullOrBlank()) {
+                return GpasPseudonymGenerator(
+                    configProperties,
+                    retryTemplate,
+                    createCustomGpasRestTemplate(configProperties)
+                )
+            }
+        } catch (e: Exception) {
+            throw RuntimeException(e)
+        }
+
+        return GpasPseudonymGenerator(configProperties, retryTemplate, restTemplate)
+    }
+
+    private fun createCustomGpasRestTemplate(configProperties: GPasConfigProperties): RestTemplate {
+        fun getSslContext(certificateLocation: String): SSLContext? {
+            val ks = KeyStore.getInstance(KeyStore.getDefaultType())
+
+            val fis = FileInputStream(certificateLocation)
+            val ca = CertificateFactory.getInstance("X.509")
+                .generateCertificate(BufferedInputStream(fis)) as X509Certificate
+
+            ks.load(null, null)
+            ks.setCertificateEntry(1.toString(), ca)
+
+            val tmf = TrustManagerFactory.getInstance(
+                TrustManagerFactory.getDefaultAlgorithm()
+            )
+            tmf.init(ks)
+
+            val sslContext = SSLContext.getInstance("TLS")
+            sslContext.init(null, tmf.trustManagers, null)
+
+            return sslContext
+        }
+
+        fun getCustomRestTemplate(customSslContext: SSLContext): RestTemplate {
+            val sslsf = SSLConnectionSocketFactory(customSslContext)
+            val socketFactoryRegistry = RegistryBuilder.create<ConnectionSocketFactory>()
+                .register("https", sslsf).register("http", PlainConnectionSocketFactory()).build()
+
+            val connectionManager = BasicHttpClientConnectionManager(
+                socketFactoryRegistry
+            )
+            val httpClient = HttpClients.custom()
+                .setConnectionManager(connectionManager).build()
+
+            val requestFactory = HttpComponentsClientHttpRequestFactory(
+                httpClient
+            )
+            return RestTemplate(requestFactory)
+        }
+
+        try {
+            if (!configProperties.sslCaLocation.isNullOrBlank()) {
+                val customSslContext = getSslContext(configProperties.sslCaLocation)
+                logger.warn(
+                    String.format(
+                        "%s has been initialized with SSL certificate %s. This is deprecated in favor of including Root CA.",
+                        this.javaClass.name, configProperties.sslCaLocation
+                    )
+                )
+
+                if (customSslContext != null) {
+                    return getCustomRestTemplate(customSslContext)
+                }
+            }
+        } catch (e: Exception) {
+            throw RuntimeException(e)
+        }
+
+        throw RuntimeException("Custom SSL configuration for gPAS not usable")
+    }
+
+    @ConditionalOnProperty(value = ["app.pseudonymizer"], havingValue = "BUILDIN")
+    @ConditionalOnMissingBean
+    @Bean
+    fun buildinPseudonymGeneratorOnDeprecatedProperty(): Generator {
+        return AnonymizingGenerator()
+    }
+
     @Bean
     fun pseudonymizeService(
         generator: Generator,

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/config/AppKafkaConfiguration.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -71,7 +71,7 @@ class AppKafkaConfiguration {
         kafkaProperties: KafkaProperties,
         kafkaResponseProcessor: KafkaResponseProcessor
     ): KafkaMessageListenerContainer<String, String> {
-        val containerProperties = ContainerProperties(kafkaProperties.outputResponseTopic)
+        val containerProperties = ContainerProperties(kafkaProperties.responseTopic)
         containerProperties.messageListener = kafkaResponseProcessor
         return KafkaMessageListenerContainer(consumerFactory, containerProperties)
     }

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/config/AppSecurityConfiguration.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2023  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -87,14 +87,9 @@ class AppSecurityConfiguration(
 
     @Bean
     @ConditionalOnProperty(value = ["app.security.enable-oidc"], havingValue = "true")
-    fun filterChainOidc(
+    fun filterChainOidc(http: HttpSecurity, passwordEncoder: PasswordEncoder, userRoleRepository: UserRoleRepository, sessionRegistry: SessionRegistry): SecurityFilterChain {
-        http: HttpSecurity,
-        passwordEncoder: PasswordEncoder,
-        userRoleRepository: UserRoleRepository,
-        sessionRegistry: SessionRegistry
-    ): SecurityFilterChain {
         http {
-            authorizeHttpRequests {
+            authorizeRequests {
                 authorize("/configs/**", hasRole("ADMIN"))
                 authorize("/mtbfile/**", hasAnyRole("MTBFILE", "ADMIN", "USER"))
                 authorize("/report/**", hasAnyRole("ADMIN", "USER"))
@@ -132,22 +127,13 @@ class AppSecurityConfiguration(
 
     @Bean
     @ConditionalOnProperty(value = ["app.security.enable-oidc"], havingValue = "true")
-    fun grantedAuthoritiesMapper(
+    fun grantedAuthoritiesMapper(userRoleRepository: UserRoleRepository, appSecurityConfigProperties: SecurityConfigProperties): GrantedAuthoritiesMapper {
-        userRoleRepository: UserRoleRepository,
-        appSecurityConfigProperties: SecurityConfigProperties
-    ): GrantedAuthoritiesMapper {
         return GrantedAuthoritiesMapper { grantedAuthority ->
             grantedAuthority.filterIsInstance<OidcUserAuthority>()
                 .onEach {
                     val userRole = userRoleRepository.findByUsername(it.userInfo.preferredUsername)
                     if (userRole.isEmpty) {
-                        userRoleRepository.save(
+                        userRoleRepository.save(UserRole(null, it.userInfo.preferredUsername, appSecurityConfigProperties.defaultNewUserRole))
-                            UserRole(
-                                null,
-                                it.userInfo.preferredUsername,
-                                appSecurityConfigProperties.defaultNewUserRole
-                            )
-                        )
                     }
                 }
                 .map {
@@ -161,7 +147,7 @@ class AppSecurityConfiguration(
     @ConditionalOnProperty(value = ["app.security.enable-oidc"], havingValue = "false", matchIfMissing = true)
     fun filterChain(http: HttpSecurity, passwordEncoder: PasswordEncoder): SecurityFilterChain {
         http {
-            authorizeHttpRequests {
+            authorizeRequests {
                 authorize("/configs/**", hasRole("ADMIN"))
                 authorize("/mtbfile/**", hasAnyRole("MTBFILE", "ADMIN"))
                 authorize("/report/**", hasRole("ADMIN"))

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/input/KafkaInputListener.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
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  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -22,13 +22,11 @@ package dev.dnpm.etl.processor.input
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Consent
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.PatientId
 import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
 import org.apache.kafka.clients.consumer.ConsumerRecord
 import org.slf4j.LoggerFactory
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.kafka.listener.MessageListener
 
 class KafkaInputListener(
@@ -37,29 +35,10 @@ class KafkaInputListener(
 ) : MessageListener<String, String> {
     private val logger = LoggerFactory.getLogger(KafkaInputListener::class.java)
 
-    override fun onMessage(record: ConsumerRecord<String, String>) {
+    override fun onMessage(data: ConsumerRecord<String, String>) {
-        when (guessMimeType(record)) {
+        val mtbFile = objectMapper.readValue(data.value(), MtbFile::class.java)
-            MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE -> handleBwhcMessage(record)
-            CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE -> handleDnpmV2Message(record)
-            else -> {
-                /* ignore other messages */
-            }
-        }
-    }
-
-    private fun guessMimeType(record: ConsumerRecord<String, String>): String {
-        if (record.headers().headers("contentType").toList().isEmpty()) {
-            // Fallback if no contentType set (old behavior)
-            return MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE
-        }
-
-        return record.headers().headers("contentType")?.firstOrNull()?.value().contentToString()
-    }
-
-    private fun handleBwhcMessage(record: ConsumerRecord<String, String>) {
-        val mtbFile = objectMapper.readValue(record.value(), MtbFile::class.java)
         val patientId = PatientId(mtbFile.patient.id)
-        val firstRequestIdHeader = record.headers().headers("requestId")?.firstOrNull()
+        val firstRequestIdHeader = data.headers().headers("requestId")?.firstOrNull()
         val requestId = if (null != firstRequestIdHeader) {
             RequestId(String(firstRequestIdHeader.value()))
         } else {
@@ -82,10 +61,4 @@ class KafkaInputListener(
             }
         }
     }
-
+}
-    private fun handleDnpmV2Message(record: ConsumerRecord<String, String>) {
-        // Do not handle DNPM-V2 for now
-        logger.warn("Ignoring MTB File in DNPM V2 format: Not implemented yet")
-    }
-
-}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/input/MtbFileRestController.kt

@@ -21,12 +21,9 @@ package dev.dnpm.etl.processor.input
 
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Consent
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.PatientId
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
 import org.slf4j.LoggerFactory
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.http.ResponseEntity
 import org.springframework.web.bind.annotation.*
 
@@ -43,26 +40,19 @@ class MtbFileRestController(
         return ResponseEntity.ok("Test")
     }
 
-    @PostMapping( consumes = [ MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE ] )
+    @PostMapping
     fun mtbFile(@RequestBody mtbFile: MtbFile): ResponseEntity<Unit> {
         if (mtbFile.consent.status == Consent.Status.ACTIVE) {
-            logger.debug("Accepted MTB File (bwHC V1) for processing")
+            logger.debug("Accepted MTB File for processing")
             requestProcessor.processMtbFile(mtbFile)
         } else {
-            logger.debug("Accepted MTB File (bwHC V1) and process deletion")
+            logger.debug("Accepted MTB File and process deletion")
             val patientId = PatientId(mtbFile.patient.id)
             requestProcessor.processDeletion(patientId)
         }
         return ResponseEntity.accepted().build()
     }
 
-    @PostMapping( consumes = [ CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE] )
-    fun mtbFile(@RequestBody mtbFile: Mtb): ResponseEntity<Unit> {
-        logger.debug("Accepted MTB File (DNPM V2) for processing")
-        requestProcessor.processMtbFile(mtbFile)
-        return ResponseEntity.accepted().build()
-    }
-
     @DeleteMapping(path = ["{patientId}"])
     fun deleteData(@PathVariable patientId: String): ResponseEntity<Unit> {
         logger.debug("Accepted patient ID to process deletion")
@@ -70,4 +60,4 @@ class MtbFileRestController(
         return ResponseEntity.accepted().build()
     }
 
-}
+}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/KafkaMtbFileSender.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -22,12 +22,10 @@ package dev.dnpm.etl.processor.output
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Consent
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
+import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
 import dev.dnpm.etl.processor.config.KafkaProperties
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
-import org.apache.kafka.clients.producer.ProducerRecord
 import org.slf4j.LoggerFactory
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.kafka.core.KafkaTemplate
 import org.springframework.retry.support.RetryTemplate
 
@@ -40,20 +38,14 @@ class KafkaMtbFileSender(
 
     private val logger = LoggerFactory.getLogger(KafkaMtbFileSender::class.java)
 
-    override fun <T> send(request: MtbFileRequest<T>): MtbFileSender.Response {
+    override fun send(request: MtbFileSender.MtbFileRequest): MtbFileSender.Response {
         return try {
             return retryTemplate.execute<MtbFileSender.Response, Exception> {
-                val record =
+                val result = kafkaTemplate.send(
-                    ProducerRecord(kafkaProperties.outputTopic, key(request), objectMapper.writeValueAsString(request))
+                    kafkaProperties.topic,
-                when (request) {
+                    key(request),
-                    is BwhcV1MtbFileRequest -> record.headers()
+                    objectMapper.writeValueAsString(Data(request.requestId, request.mtbFile))
-                        .add("contentType", MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE.toByteArray())
+                )
-
-                    is DnpmV2MtbFileRequest -> record.headers()
-                        .add("contentType", CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE.toByteArray())
-                }
-
-                val result = kafkaTemplate.send(record)
                 if (result.get() != null) {
                     logger.debug("Sent file via KafkaMtbFileSender")
                     MtbFileSender.Response(RequestStatus.UNKNOWN)
@@ -67,7 +59,7 @@ class KafkaMtbFileSender(
         }
     }
 
-    override fun send(request: DeleteRequest): MtbFileSender.Response {
+    override fun send(request: MtbFileSender.DeleteRequest): MtbFileSender.Response {
         val dummyMtbFile = MtbFile.builder()
             .withConsent(
                 Consent.builder()
@@ -79,15 +71,12 @@ class KafkaMtbFileSender(
 
         return try {
             return retryTemplate.execute<MtbFileSender.Response, Exception> {
-                val record =
+                val result = kafkaTemplate.send(
-                    ProducerRecord(
+                    kafkaProperties.topic,
-                        kafkaProperties.outputTopic,
+                    key(request),
-                        key(request),
+                    objectMapper.writeValueAsString(Data(request.requestId, dummyMtbFile))
-                        // Always use old BwhcV1FileRequest with Consent REJECT
+                )
-                        objectMapper.writeValueAsString(BwhcV1MtbFileRequest(request.requestId, dummyMtbFile))
-                    )
 
-                val result = kafkaTemplate.send(record)
                 if (result.get() != null) {
                     logger.debug("Sent deletion request via KafkaMtbFileSender")
                     MtbFileSender.Response(RequestStatus.UNKNOWN)
@@ -102,15 +91,16 @@ class KafkaMtbFileSender(
     }
 
     override fun endpoint(): String {
-        return "${this.kafkaProperties.servers} (${this.kafkaProperties.outputTopic}/${this.kafkaProperties.outputResponseTopic})"
+        return "${this.kafkaProperties.servers} (${this.kafkaProperties.topic}/${this.kafkaProperties.responseTopic})"
     }
 
-    private fun key(request: MtbRequest): String {
+    private fun key(request: MtbFileSender.MtbFileRequest): String {
-        return when (request) {
+        return "{\"pid\": \"${request.mtbFile.patient.id}\"}"
-            is BwhcV1MtbFileRequest -> "{\"pid\": \"${request.content.patient.id}\"}"
-            is DnpmV2MtbFileRequest -> "{\"pid\": \"${request.content.patient.id}\"}"
-            is DeleteRequest -> "{\"pid\": \"${request.patientId.value}\"}"
-            else -> throw IllegalArgumentException("Unsupported request type: ${request::class.simpleName}")
-        }
     }
-}
+
+    private fun key(request: MtbFileSender.DeleteRequest): String {
+        return "{\"pid\": \"${request.patientId.value}\"}"
+    }
+
+    data class Data(val requestId: RequestId, val content: MtbFile)
+}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/MtbFileSender.kt

@@ -19,17 +19,25 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.output
 
+import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
+import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
+import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
 import org.springframework.http.HttpStatusCode
 
 interface MtbFileSender {
-    fun <T> send(request: MtbFileRequest<T>): Response
+    fun send(request: MtbFileRequest): Response
 
     fun send(request: DeleteRequest): Response
 
     fun endpoint(): String
 
     data class Response(val status: RequestStatus, val body: String = "")
+
+    data class MtbFileRequest(val requestId: RequestId, val mtbFile: MtbFile)
+
+    data class DeleteRequest(val requestId: RequestId, val patientId: PatientPseudonym)
+
 }
 
 fun Int.asRequestStatus(): RequestStatus {
@@ -43,4 +51,4 @@ fun Int.asRequestStatus(): RequestStatus {
 
 fun HttpStatusCode.asRequestStatus(): RequestStatus {
     return this.value().asRequestStatus()
-}
+}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/MtbRequest.kt

@@ -1,59 +0,0 @@
-/*
- * This file is part of ETL-Processor
- *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
- *
- * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
- * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
- * by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
- * (at your option) any later version.
- *
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU Affero General Public License for more details.
- *
- * You should have received a copy of the GNU Affero General Public License
- * along with this program.  If not, see <https://www.gnu.org/licenses/>.
- */
-
-package dev.dnpm.etl.processor.output
-
-import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
-import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
-import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
-
-interface MtbRequest {
-    val requestId: RequestId
-}
-
-sealed interface MtbFileRequest<out T> : MtbRequest {
-    override val requestId: RequestId
-    val content: T
-
-    fun patientPseudonym(): PatientPseudonym
-}
-
-data class BwhcV1MtbFileRequest(
-    override val requestId: RequestId,
-    override val content: MtbFile
-) : MtbFileRequest<MtbFile> {
-    override fun patientPseudonym(): PatientPseudonym {
-        return PatientPseudonym(content.patient.id)
-    }
-}
-
-data class DnpmV2MtbFileRequest(
-    override val requestId: RequestId,
-    override val content: Mtb
-) : MtbFileRequest<Mtb> {
-    override fun patientPseudonym(): PatientPseudonym {
-        return PatientPseudonym(content.patient.id)
-    }
-}
-
-data class DeleteRequest(
-    override val requestId: RequestId,
-    val patientId: PatientPseudonym
-) : MtbRequest

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/RestMtbFileSender.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
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+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -19,11 +19,10 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor.output
 
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
-import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
 import dev.dnpm.etl.processor.config.RestTargetProperties
-import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.ReportService
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
+import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
+import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.ReportService
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.asRequestStatus
 import org.slf4j.LoggerFactory
 import org.springframework.http.HttpEntity
@@ -47,11 +46,11 @@ abstract class RestMtbFileSender(
 
     abstract fun deleteUrl(patientId: PatientPseudonym): String
 
-    override fun <T> send(request: MtbFileRequest<T>): MtbFileSender.Response {
+    override fun send(request: MtbFileSender.MtbFileRequest): MtbFileSender.Response {
         try {
             return retryTemplate.execute<MtbFileSender.Response, Exception> {
-                val headers = getHttpHeaders(request)
+                val headers = getHttpHeaders()
-                val entityReq = HttpEntity(request.content, headers)
+                val entityReq = HttpEntity(request.mtbFile, headers)
                 val response = restTemplate.postForEntity(
                     sendUrl(),
                     entityReq,
@@ -77,10 +76,10 @@ abstract class RestMtbFileSender(
         return MtbFileSender.Response(RequestStatus.ERROR, "Sonstiger Fehler bei der Übertragung")
     }
 
-    override fun send(request: DeleteRequest): MtbFileSender.Response {
+    override fun send(request: MtbFileSender.DeleteRequest): MtbFileSender.Response {
         try {
             return retryTemplate.execute<MtbFileSender.Response, Exception> {
-                val headers = getHttpHeaders(request)
+                val headers = getHttpHeaders()
                 val entityReq = HttpEntity(null, headers)
                 restTemplate.delete(
                     deleteUrl(request.patientId),
@@ -103,15 +102,11 @@ abstract class RestMtbFileSender(
         return this.restTargetProperties.uri.orEmpty()
     }
 
-    private fun getHttpHeaders(request: MtbRequest): HttpHeaders {
+    private fun getHttpHeaders(): HttpHeaders {
         val username = restTargetProperties.username
         val password = restTargetProperties.password
         val headers = HttpHeaders()
-        headers.contentType = when (request) {
+        headers.contentType = MediaType.APPLICATION_JSON
-            is BwhcV1MtbFileRequest -> MediaType.APPLICATION_JSON
-            is DnpmV2MtbFileRequest -> CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON
-            else -> MediaType.APPLICATION_JSON
-        }
 
         if (username.isNullOrBlank() || password.isNullOrBlank()) {
             return headers
@@ -121,4 +116,4 @@ abstract class RestMtbFileSender(
         return headers
     }
 
-}
+}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/AnonymizingGenerator.kt

@@ -21,7 +21,6 @@ package dev.dnpm.etl.processor.pseudonym
 
 import org.apache.commons.codec.binary.Base32
 import org.apache.commons.codec.digest.DigestUtils
-import org.apache.commons.math3.random.RandomDataGenerator
 
 
 class AnonymizingGenerator : Generator {
@@ -32,9 +31,4 @@ class AnonymizingGenerator : Generator {
             .lowercase()
     }
 
-    override fun generateGenomDeTan(id: String?): String? {
-        val randomDataGenerator = RandomDataGenerator()
-        return randomDataGenerator.nextSecureHexString(64).lowercase()
-    }
-
 }

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/PseudonymizeService.kt

@@ -35,10 +35,6 @@ class PseudonymizeService(
         }
     }
 
-    fun genomDeTan(patientId: PatientId): String {
-        return generator.generateGenomDeTan(patientId.value)
-    }
-
     fun prefix(): String {
         return configProperties.prefix
     }

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/extensions.kt

@@ -21,12 +21,12 @@ package dev.dnpm.etl.processor.pseudonym
 
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
 import dev.dnpm.etl.processor.PatientId
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
 import org.apache.commons.codec.digest.DigestUtils
 
 /** Replaces patient ID with generated patient pseudonym
  *
  * @param pseudonymizeService The pseudonymizeService to be used
+ *
  * @return The MTB file containing patient pseudonymes
  */
 infix fun MtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
@@ -49,11 +49,7 @@ infix fun MtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
     }
     this.lastGuidelineTherapies?.forEach { it.patient = patientPseudonym }
     this.molecularPathologyFindings?.forEach { it.patient = patientPseudonym }
-    this.molecularTherapies?.forEach { molecularTherapy ->
+    this.molecularTherapies?.forEach { molecularTherapy -> molecularTherapy.history.forEach { it.patient = patientPseudonym } }
-        molecularTherapy.history.forEach {
-            it.patient = patientPseudonym
-        }
-    }
     this.ngsReports?.forEach { it.patient = patientPseudonym }
     this.previousGuidelineTherapies?.forEach { it.patient = patientPseudonym }
     this.rebiopsyRequests?.forEach { it.patient = patientPseudonym }
@@ -67,6 +63,7 @@ infix fun MtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
  * Creates new hash of content IDs with given prefix except for patient IDs
  *
  * @param pseudonymizeService The pseudonymizeService to be used
+ *
  * @return The MTB file containing rehashed content IDs
  */
 infix fun MtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
@@ -123,8 +120,8 @@ infix fun MtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService)
             id = id?.let { anonymize(it) }
         }
     }
-    this.geneticCounsellingRequests?.onEach { geneticCounsellingRequest ->
+    this.geneticCounsellingRequests?.onEach { geneticCounsellingRequest -> 
-        geneticCounsellingRequest?.apply {
+        geneticCounsellingRequest?.apply { 
             id = id?.let { anonymize(it) }
         }
     }
@@ -226,99 +223,4 @@ infix fun MtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService)
             id = id?.let { anonymize(it) }
         }
     }
-}
-
-/** Replaces patient ID with generated patient pseudonym
- *
- * @since 0.11.0
- *
- * @param pseudonymizeService The pseudonymizeService to be used
- * @return The MTB file containing patient pseudonymes
- */
-infix fun Mtb.pseudonymizeWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-    val patientPseudonym = pseudonymizeService.patientPseudonym(PatientId(this.patient.id)).value
-
-    this.episodesOfCare?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.carePlans?.forEach {
-        it.patient.id = patientPseudonym
-        it.rebiopsyRequests?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.histologyReevaluationRequests?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.medicationRecommendations.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.studyEnrollmentRecommendations?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.procedureRecommendations?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.geneticCounselingRecommendation.patient.id = patientPseudonym
-    }
-    this.diagnoses?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.guidelineTherapies?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.guidelineProcedures?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.patient.id = patientPseudonym
-    this.claims?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.claimResponses?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.diagnoses?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.familyMemberHistories?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.histologyReports?.forEach {
-        it.patient.id = patientPseudonym
-        it.results.tumorMorphology?.patient?.id = patientPseudonym
-        it.results.tumorCellContent?.patient?.id = patientPseudonym
-    }
-    this.ngsReports?.forEach {
-        it.patient.id = patientPseudonym
-        it.results.simpleVariants?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.results.copyNumberVariants?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.results.dnaFusions?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.results.rnaFusions?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.results.tumorCellContent?.patient?.id = patientPseudonym
-        it.results.brcaness?.patient?.id = patientPseudonym
-        it.results.tmb?.patient?.id = patientPseudonym
-        it.results.hrdScore?.patient?.id = patientPseudonym
-    }
-    this.ihcReports?.forEach {
-        it.patient.id = patientPseudonym
-        it.results.msiMmr?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-        it.results.proteinExpression?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    }
-    this.responses?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.specimens?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.priorDiagnosticReports?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.performanceStatus?.forEach { it.patient.id = patientPseudonym }
-    this.systemicTherapies?.forEach {
-        it.history?.forEach {
-            it.patient.id = patientPseudonym
-        }
-    }
-    this.followUps?.forEach {
-        it.patient.id = patientPseudonym
-    }
-}
-
-/**
- * Creates new hash of content IDs with given prefix except for patient IDs
- *
- * @since 0.11.0
- *
- * @param pseudonymizeService The pseudonymizeService to be used
- * @return The MTB file containing rehashed content IDs
- */
-infix fun Mtb.anonymizeContentWith(pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-    val prefix = pseudonymizeService.prefix()
-
-    fun anonymize(id: String): String {
-        val hash = DigestUtils.sha256Hex("$prefix-$id").substring(0, 41).lowercase()
-        return "$prefix$hash"
-    }
-
-    this.episodesOfCare?.forEach {
-        it?.apply {
-            id = id?.let {
-                anonymize(it)
-            }
-        }
-    }
-
-    // TODO all other properties
-}
-
-infix fun Mtb.addGenomDeTan(pseudonymizeService: PseudonymizeService)
-{
-    this.metadata.transferTan = pseudonymizeService.genomDeTan(PatientId(this.patient.id))
 }

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/services/RequestProcessor.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2023  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -27,14 +27,10 @@ import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.Report
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.Request
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestType
-import dev.dnpm.etl.processor.output.*
+import dev.dnpm.etl.processor.output.MtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.PseudonymizeService
-import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.addGenomDeTan
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.anonymizeContentWith
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.pseudonymizeWith
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.ConsentProvision
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.ModelProjectConsentPurpose
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
 import org.apache.commons.codec.binary.Base32
 import org.apache.commons.codec.digest.DigestUtils
 import org.springframework.context.ApplicationEventPublisher
@@ -59,47 +55,29 @@ class RequestProcessor(
 
     fun processMtbFile(mtbFile: MtbFile, requestId: RequestId) {
         val pid = PatientId(mtbFile.patient.id)
+
         mtbFile pseudonymizeWith pseudonymizeService
         mtbFile anonymizeContentWith pseudonymizeService
-        val request = BwhcV1MtbFileRequest(requestId, transformationService.transform(mtbFile))
-        saveAndSend(request, pid)
-    }
 
-    fun processMtbFile(mtbFile: Mtb) {
+        val request = MtbFileSender.MtbFileRequest(requestId, transformationService.transform(mtbFile))
-        processMtbFile(mtbFile, randomRequestId())
-    }
 
-    fun processMtbFile(mtbFile: Mtb, requestId: RequestId) {
+        val patientPseudonym = PatientPseudonym(request.mtbFile.patient.id)
-        val pid = PatientId(mtbFile.patient.id)
-        val isModelProjectConsented = mtbFile.metadata?.modelProjectConsent?.provisions?.any { p ->
-            p.purpose == ModelProjectConsentPurpose.SEQUENCING
-                    && p.type == ConsentProvision.PERMIT
-        } == true
-        if (isModelProjectConsented) {
-            mtbFile addGenomDeTan pseudonymizeService
-        }
-        mtbFile pseudonymizeWith pseudonymizeService
-        mtbFile anonymizeContentWith pseudonymizeService
-        val request = DnpmV2MtbFileRequest(requestId, transformationService.transform(mtbFile))
-        saveAndSend(request, pid)
-    }
 
-    private fun <T> saveAndSend(request: MtbFileRequest<T>, pid: PatientId) {
         requestService.save(
             Request(
-                request.requestId,
+                requestId,
-                request.patientPseudonym(),
+                patientPseudonym,
                 pid,
-                fingerprint(request),
+                fingerprint(request.mtbFile),
                 RequestType.MTB_FILE,
                 RequestStatus.UNKNOWN
             )
         )
 
-        if (appConfigProperties.duplicationDetection && isDuplication(request)) {
+        if (appConfigProperties.duplicationDetection && isDuplication(mtbFile)) {
             applicationEventPublisher.publishEvent(
                 ResponseEvent(
-                    request.requestId,
+                    requestId,
                     Instant.now(),
                     RequestStatus.DUPLICATION
                 )
@@ -111,7 +89,7 @@ class RequestProcessor(
 
         applicationEventPublisher.publishEvent(
             ResponseEvent(
-                request.requestId,
+                requestId,
                 Instant.now(),
                 responseStatus.status,
                 when (responseStatus.status) {
@@ -122,22 +100,16 @@ class RequestProcessor(
         )
     }
 
-    private fun <T> isDuplication(pseudonymizedMtbFileRequest: MtbFileRequest<T>): Boolean {
+    private fun isDuplication(pseudonymizedMtbFile: MtbFile): Boolean {
-        val patientPseudonym = when (pseudonymizedMtbFileRequest) {
+        val patientPseudonym = PatientPseudonym(pseudonymizedMtbFile.patient.id)
-            is BwhcV1MtbFileRequest -> PatientPseudonym(pseudonymizedMtbFileRequest.content.patient.id)
-            is DnpmV2MtbFileRequest -> PatientPseudonym(pseudonymizedMtbFileRequest.content.patient.id)
-        }
 
         val lastMtbFileRequestForPatient =
             requestService.lastMtbFileRequestForPatientPseudonym(patientPseudonym)
-        val isLastRequestDeletion =
+        val isLastRequestDeletion = requestService.isLastRequestWithKnownStatusDeletion(patientPseudonym)
-            requestService.isLastRequestWithKnownStatusDeletion(patientPseudonym)
 
         return null != lastMtbFileRequestForPatient
                 && !isLastRequestDeletion
-                && lastMtbFileRequestForPatient.fingerprint == fingerprint(
+                && lastMtbFileRequestForPatient.fingerprint == fingerprint(pseudonymizedMtbFile)
-            pseudonymizedMtbFileRequest
-        )
     }
 
     fun processDeletion(patientId: PatientId) {
@@ -159,7 +131,7 @@ class RequestProcessor(
                 )
             )
 
-            val responseStatus = sender.send(DeleteRequest(requestId, patientPseudonym))
+            val responseStatus = sender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(requestId, patientPseudonym))
 
             applicationEventPublisher.publishEvent(
                 ResponseEvent(
@@ -188,11 +160,8 @@ class RequestProcessor(
         }
     }
 
-    private fun <T> fingerprint(request: MtbFileRequest<T>): Fingerprint {
+    private fun fingerprint(mtbFile: MtbFile): Fingerprint {
-        return when (request) {
+        return fingerprint(objectMapper.writeValueAsString(mtbFile))
-            is BwhcV1MtbFileRequest -> fingerprint(objectMapper.writeValueAsString(request.content))
-            is DnpmV2MtbFileRequest -> fingerprint(objectMapper.writeValueAsString(request.content))
-        }
     }
 
     private fun fingerprint(s: String): Fingerprint {
@@ -203,4 +172,4 @@ class RequestProcessor(
         )
     }
 
-}
+}

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/services/TransformationService.kt

@@ -23,21 +23,10 @@ import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import com.jayway.jsonpath.JsonPath
 import com.jayway.jsonpath.PathNotFoundException
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
 
 class TransformationService(private val objectMapper: ObjectMapper, private val transformations: List<Transformation>) {
     fun transform(mtbFile: MtbFile): MtbFile {
-        val json = transform(objectMapper.writeValueAsString(mtbFile))
+        var json = objectMapper.writeValueAsString(mtbFile)
-        return objectMapper.readValue(json, MtbFile::class.java)
-    }
-
-    fun transform(mtbFile: Mtb): Mtb {
-        val json = transform(objectMapper.writeValueAsString(mtbFile))
-        return objectMapper.readValue(json, Mtb::class.java)
-    }
-
-    private fun transform(content: String): String {
-        var json = content
 
         transformations.forEach { transformation ->
             val jsonPath = JsonPath.parse(json)
@@ -59,7 +48,7 @@ class TransformationService(private val objectMapper: ObjectMapper, private val
             json = jsonPath.jsonString()
         }
 
-        return json
+        return objectMapper.readValue(json, MtbFile::class.java)
     }
 
     fun getTransformations(): List<Transformation> {

src/main/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/types.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -19,7 +19,6 @@
 
 package dev.dnpm.etl.processor
 
-import org.springframework.http.MediaType
 import java.util.*
 
 class Fingerprint(val value: String) {
@@ -47,17 +46,4 @@ value class PatientId(val value: String)
 @JvmInline
 value class PatientPseudonym(val value: String)
 
-fun emptyPatientPseudonym() = PatientPseudonym("")
+fun emptyPatientPseudonym() = PatientPseudonym("")
-
-/**
- * Custom MediaTypes
- *
- * @since 0.11.0
- */
-object CustomMediaType {
-    val APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON = MediaType("application", "vnd.dnpm.v2.mtb+json")
-    const val APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE = "application/vnd.dnpm.v2.mtb+json"
-
-    val APPLICATION_VND_DNPM_V2_RD_JSON = MediaType("application", "vnd.dnpm.v2.rd+json")
-    const val APPLICATION_VND_DNPM_V2_RD_JSON_VALUE = "application/vnd.dnpm.v2.rd+json"
-}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/input/KafkaInputListenerTest.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -23,7 +23,6 @@ import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Consent
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.MtbFile
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Patient
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
 import org.apache.kafka.clients.consumer.ConsumerRecord
 import org.apache.kafka.common.header.internals.RecordHeader
@@ -64,17 +63,9 @@ class KafkaInputListenerTest {
             .withConsent(Consent.builder().withStatus(Consent.Status.ACTIVE).build())
             .build()
 
-        kafkaInputListener.onMessage(
+        kafkaInputListener.onMessage(ConsumerRecord("testtopic", 0, 0, "", this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile)))
-            ConsumerRecord(
-                "testtopic",
-                0,
-                0,
-                "",
-                this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile)
-            )
-        )
 
-        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
     }
 
     @Test
@@ -84,15 +75,7 @@ class KafkaInputListenerTest {
             .withConsent(Consent.builder().withStatus(Consent.Status.REJECTED).build())
             .build()
 
-        kafkaInputListener.onMessage(
+        kafkaInputListener.onMessage(ConsumerRecord("testtopic", 0, 0, "", this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile)))
-            ConsumerRecord(
-                "testtopic",
-                0,
-                0,
-                "",
-                this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile)
-            )
-        )
 
         verify(requestProcessor, times(1)).processDeletion(anyValueClass())
     }
@@ -106,22 +89,10 @@ class KafkaInputListenerTest {
 
         val headers = RecordHeaders(listOf(RecordHeader("requestId", UUID.randomUUID().toString().toByteArray())))
         kafkaInputListener.onMessage(
-            ConsumerRecord(
+            ConsumerRecord("testtopic", 0, 0, -1L, TimestampType.NO_TIMESTAMP_TYPE, -1, -1, "", this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile), headers, Optional.empty())
-                "testtopic",
-                0,
-                0,
-                -1L,
-                TimestampType.NO_TIMESTAMP_TYPE,
-                -1,
-                -1,
-                "",
-                this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile),
-                headers,
-                Optional.empty()
-            )
         )
 
-        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>(), anyValueClass())
+        verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any(), anyValueClass())
     }
 
     @Test
@@ -133,52 +104,9 @@ class KafkaInputListenerTest {
 
         val headers = RecordHeaders(listOf(RecordHeader("requestId", UUID.randomUUID().toString().toByteArray())))
         kafkaInputListener.onMessage(
-            ConsumerRecord(
+            ConsumerRecord("testtopic", 0, 0, -1L, TimestampType.NO_TIMESTAMP_TYPE, -1, -1, "", this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile), headers, Optional.empty())
-                "testtopic",
-                0,
-                0,
-                -1L,
-                TimestampType.NO_TIMESTAMP_TYPE,
-                -1,
-                -1,
-                "",
-                this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile),
-                headers,
-                Optional.empty()
-            )
         )
         verify(requestProcessor, times(1)).processDeletion(anyValueClass(), anyValueClass())
     }
 
-    @Test
+}
-    fun shouldNotProcessDnpmV2Request() {
-        val mtbFile = MtbFile.builder()
-            .withPatient(Patient.builder().withId("DUMMY_12345678").build())
-            .withConsent(Consent.builder().withStatus(Consent.Status.REJECTED).build())
-            .build()
-
-        val headers = RecordHeaders(
-            listOf(
-                RecordHeader("requestId", UUID.randomUUID().toString().toByteArray()),
-                RecordHeader("contentType", CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE.toByteArray())
-            )
-        )
-        kafkaInputListener.onMessage(
-            ConsumerRecord(
-                "testtopic",
-                0,
-                0,
-                -1L,
-                TimestampType.NO_TIMESTAMP_TYPE,
-                -1,
-                -1,
-                "",
-                this.objectMapper.writeValueAsString(mtbFile),
-                headers,
-                Optional.empty()
-            )
-        )
-        verify(requestProcessor, times(0)).processDeletion(anyValueClass(), anyValueClass())
-    }
-
-}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/input/MtbFileRestControllerTest.kt

@@ -21,9 +21,7 @@ package dev.dnpm.etl.processor.input
 
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.services.RequestProcessor
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Mtb
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
@@ -34,7 +32,6 @@ import org.mockito.Mockito.verify
 import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension
 import org.mockito.kotlin.any
 import org.mockito.kotlin.anyValueClass
-import org.springframework.core.io.ClassPathResource
 import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.test.web.servlet.MockMvc
 import org.springframework.test.web.servlet.delete
@@ -73,7 +70,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
                 }
             }
 
-            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
         }
 
         @Test
@@ -129,7 +126,7 @@ class MtbFileRestControllerTest {
                 }
             }
 
-            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<MtbFile>())
+            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any())
         }
 
         @Test
@@ -158,40 +155,6 @@ class MtbFileRestControllerTest {
         }
     }
 
-    @Nested
-    inner class RequestsForDnpmDataModel21 {
-
-        private lateinit var mockMvc: MockMvc
-
-        private lateinit var requestProcessor: RequestProcessor
-
-        @BeforeEach
-        fun setup(
-            @Mock requestProcessor: RequestProcessor
-        ) {
-            this.requestProcessor = requestProcessor
-            val controller = MtbFileRestController(requestProcessor)
-            this.mockMvc = MockMvcBuilders.standaloneSetup(controller).build()
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldRespondPostRequest() {
-            val mtbFileContent = ClassPathResource("mv64e-mtb-fake-patient.json").inputStream.readAllBytes().toString(Charsets.UTF_8)
-
-            mockMvc.post("/mtb") {
-                content = mtbFileContent
-                contentType = CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON
-            }.andExpect {
-                status {
-                    isAccepted()
-                }
-            }
-
-            verify(requestProcessor, times(1)).processMtbFile(any<Mtb>())
-        }
-
-    }
-
     companion object {
         fun bwhcMtbFileContent(consentStatus: Consent.Status) = MtbFile.builder()
             .withPatient(

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/KafkaMtbFileSenderTest.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2024  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -21,262 +21,166 @@ package dev.dnpm.etl.processor.output
 
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
-import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Patient
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
 import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
 import dev.dnpm.etl.processor.config.KafkaProperties
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.*
-import org.apache.kafka.clients.producer.ProducerRecord
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
-import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
 import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith
 import org.junit.jupiter.params.ParameterizedTest
 import org.junit.jupiter.params.provider.MethodSource
+import org.mockito.ArgumentMatchers.anyString
 import org.mockito.Mock
 import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension
 import org.mockito.kotlin.*
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.kafka.core.KafkaTemplate
 import org.springframework.kafka.support.SendResult
 import org.springframework.retry.policy.SimpleRetryPolicy
 import org.springframework.retry.support.RetryTemplateBuilder
-import java.time.Instant
-import java.util.*
 import java.util.concurrent.CompletableFuture.completedFuture
 import java.util.concurrent.ExecutionException
 
 @ExtendWith(MockitoExtension::class)
 class KafkaMtbFileSenderTest {
 
-    @Nested
+    private lateinit var kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
-    inner class BwhcV1Record {
 
-        private lateinit var kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
+    private lateinit var kafkaMtbFileSender: KafkaMtbFileSender
 
-        private lateinit var kafkaMtbFileSender: KafkaMtbFileSender
+    private lateinit var objectMapper: ObjectMapper
 
-        private lateinit var objectMapper: ObjectMapper
+    @BeforeEach
+    fun setup(
+        @Mock kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
+    ) {
+        val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
+        val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
 
-        @BeforeEach
+        this.objectMapper = ObjectMapper()
-        fun setup(
+        this.kafkaTemplate = kafkaTemplate
-            @Mock kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
-        ) {
-            val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
-
-            this.objectMapper = ObjectMapper()
-            this.kafkaTemplate = kafkaTemplate
-
-            this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, objectMapper)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldSendMtbFileRequestAndReturnExpectedState(testData: TestData) {
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            val response = kafkaMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, bwhcV1MtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(testData.requestStatus)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldSendDeleteRequestAndReturnExpectedState(testData: TestData) {
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            val response = kafkaMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(testData.requestStatus)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldSendMtbFileRequestWithCorrectKeyAndHeaderAndBody() {
-            doAnswer {
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, bwhcV1MtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
-
-            val captor = argumentCaptor<ProducerRecord<String, String>>()
-            verify(kafkaTemplate, times(1)).send(captor.capture())
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isEqualTo("{\"pid\": \"PID\"}")
-            assertThat(captor.firstValue.headers().headers("contentType")).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.headers().headers("contentType")?.firstOrNull()?.value()).isEqualTo(MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE.toByteArray())
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isEqualTo(objectMapper.writeValueAsString(bwhcV1kafkaRecordData(TEST_REQUEST_ID, Consent.Status.ACTIVE)))
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldSendDeleteRequestWithCorrectKeyAndBody() {
-            doAnswer {
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
-
-            val captor = argumentCaptor<ProducerRecord<String, String>>()
-            verify(kafkaTemplate, times(1)).send(captor.capture())
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isEqualTo("{\"pid\": \"PID\"}")
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isEqualTo(objectMapper.writeValueAsString(bwhcV1kafkaRecordData(TEST_REQUEST_ID, Consent.Status.REJECTED)))
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldRetryOnMtbFileKafkaSendError(testData: TestData) {
-            val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(3)).build()
-            this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(this.kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, this.objectMapper)
-
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, bwhcV1MtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
-
-            val expectedCount = when (testData.exception) {
-                // OK - No Retry
-                null -> times(1)
-                // Request failed - Retry max 3 times
-                else -> times(3)
-            }
-
-            verify(kafkaTemplate, expectedCount).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldRetryOnDeleteKafkaSendError(testData: TestData) {
-            val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(3)).build()
-            this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(this.kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, this.objectMapper)
-
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
-
-            val expectedCount = when (testData.exception) {
-                // OK - No Retry
-                null -> times(1)
-                // Request failed - Retry max 3 times
-                else -> times(3)
-            }
-
-            verify(kafkaTemplate, expectedCount).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-        }
 
+        this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, objectMapper)
     }
 
-    @Nested
+    @ParameterizedTest
-    inner class DnpmV2Record {
+    @MethodSource("requestWithResponseSource")
-
+    fun shouldSendMtbFileRequestAndReturnExpectedState(testData: TestData) {
-        private lateinit var kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
+        doAnswer {
-
+            if (null != testData.exception) {
-        private lateinit var kafkaMtbFileSender: KafkaMtbFileSender
+                throw testData.exception
-
-        private lateinit var objectMapper: ObjectMapper
-
-        @BeforeEach
-        fun setup(
-            @Mock kafkaTemplate: KafkaTemplate<String, String>
-        ) {
-            val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
-
-            this.objectMapper = ObjectMapper()
-            this.kafkaTemplate = kafkaTemplate
-
-            this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, objectMapper)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldSendMtbFileRequestAndReturnExpectedState(testData: TestData) {
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            val response = kafkaMtbFileSender.send(DnpmV2MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, dnpmV2MtbFile()))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(testData.requestStatus)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldSendMtbFileRequestWithCorrectKeyAndHeaderAndBody() {
-            doAnswer {
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(DnpmV2MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, dnpmV2MtbFile()))
-
-            val captor = argumentCaptor<ProducerRecord<String, String>>()
-            verify(kafkaTemplate, times(1)).send(captor.capture())
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.key()).isEqualTo("{\"pid\": \"PID\"}")
-            assertThat(captor.firstValue.headers().headers("contentType")).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.headers().headers("contentType")?.firstOrNull()?.value()).isEqualTo(CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE.toByteArray())
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isNotNull
-            assertThat(captor.firstValue.value()).isEqualTo(objectMapper.writeValueAsString(dnmpV2kafkaRecordData(TEST_REQUEST_ID)))
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.KafkaMtbFileSenderTest#requestWithResponseSource")
-        fun shouldRetryOnMtbFileKafkaSendError(testData: TestData) {
-            val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(3)).build()
-            this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(this.kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, this.objectMapper)
-
-            doAnswer {
-                if (null != testData.exception) {
-                    throw testData.exception
-                }
-                completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
-            }.whenever(kafkaTemplate).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
-
-            kafkaMtbFileSender.send(DnpmV2MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, dnpmV2MtbFile()))
-
-            val expectedCount = when (testData.exception) {
-                // OK - No Retry
-                null -> times(1)
-                // Request failed - Retry max 3 times
-                else -> times(3)
             }
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
 
-            verify(kafkaTemplate, expectedCount).send(any<ProducerRecord<String, String>>())
+        val response = kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(testData.requestStatus)
+    }
+
+    @ParameterizedTest
+    @MethodSource("requestWithResponseSource")
+    fun shouldSendDeleteRequestAndReturnExpectedState(testData: TestData) {
+        doAnswer {
+            if (null != testData.exception) {
+                throw testData.exception
+            }
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
+
+        val response = kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(testData.requestStatus)
+    }
+
+    @Test
+    fun shouldSendMtbFileRequestWithCorrectKeyAndBody() {
+        doAnswer {
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
+
+        kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
+
+        val captor = argumentCaptor<String>()
+        verify(kafkaTemplate, times(1)).send(anyString(), captor.capture(), captor.capture())
+        assertThat(captor.firstValue).isNotNull
+        assertThat(captor.firstValue).isEqualTo("{\"pid\": \"PID\"}")
+        assertThat(captor.secondValue).isNotNull
+        assertThat(captor.secondValue).isEqualTo(objectMapper.writeValueAsString(kafkaRecordData(TEST_REQUEST_ID, Consent.Status.ACTIVE)))
+    }
+
+    @Test
+    fun shouldSendDeleteRequestWithCorrectKeyAndBody() {
+        doAnswer {
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
+
+        kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+
+        val captor = argumentCaptor<String>()
+        verify(kafkaTemplate, times(1)).send(anyString(), captor.capture(), captor.capture())
+        assertThat(captor.firstValue).isNotNull
+        assertThat(captor.firstValue).isEqualTo("{\"pid\": \"PID\"}")
+        assertThat(captor.secondValue).isNotNull
+        assertThat(captor.secondValue).isEqualTo(objectMapper.writeValueAsString(kafkaRecordData(TEST_REQUEST_ID, Consent.Status.REJECTED)))
+    }
+
+    @ParameterizedTest
+    @MethodSource("requestWithResponseSource")
+    fun shouldRetryOnMtbFileKafkaSendError(testData: TestData) {
+        val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
+        val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(3)).build()
+        this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(this.kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, this.objectMapper)
+
+        doAnswer {
+            if (null != testData.exception) {
+                throw testData.exception
+            }
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
+
+        kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile(Consent.Status.ACTIVE)))
+
+        val expectedCount = when (testData.exception) {
+            // OK - No Retry
+            null -> times(1)
+            // Request failed - Retry max 3 times
+            else -> times(3)
         }
 
+        verify(kafkaTemplate, expectedCount).send(anyString(), anyString(), anyString())
+    }
+
+    @ParameterizedTest
+    @MethodSource("requestWithResponseSource")
+    fun shouldRetryOnDeleteKafkaSendError(testData: TestData) {
+        val kafkaProperties = KafkaProperties("testtopic")
+        val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(3)).build()
+        this.kafkaMtbFileSender = KafkaMtbFileSender(this.kafkaTemplate, kafkaProperties, retryTemplate, this.objectMapper)
+
+        doAnswer {
+            if (null != testData.exception) {
+                throw testData.exception
+            }
+            completedFuture(SendResult<String, String>(null, null))
+        }.whenever(kafkaTemplate).send(anyString(), anyString(), anyString())
+
+        kafkaMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+
+        val expectedCount = when (testData.exception) {
+            // OK - No Retry
+            null -> times(1)
+            // Request failed - Retry max 3 times
+            else -> times(3)
+        }
+
+        verify(kafkaTemplate, expectedCount).send(anyString(), anyString(), anyString())
     }
 
     companion object {
         val TEST_REQUEST_ID = RequestId("TestId")
         val TEST_PATIENT_PSEUDONYM = PatientPseudonym("PID")
 
-        fun bwhcV1MtbFile(consentStatus: Consent.Status): MtbFile {
+        fun mtbFile(consentStatus: Consent.Status): MtbFile {
             return if (consentStatus == Consent.Status.ACTIVE) {
                 MtbFile.builder()
                     .withPatient(
@@ -311,35 +215,8 @@ class KafkaMtbFileSenderTest {
             }.build()
         }
 
-        fun dnpmV2MtbFile(): Mtb {
+        fun kafkaRecordData(requestId: RequestId, consentStatus: Consent.Status): KafkaMtbFileSender.Data {
-            return Mtb().apply {
+            return KafkaMtbFileSender.Data(requestId, mtbFile(consentStatus))
-                this.patient = dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Patient().apply {
-                    this.id = "PID"
-                    this.birthDate = Date.from(Instant.now())
-                    this.gender = GenderCoding().apply {
-                        this.code = GenderCodingCode.MALE
-                    }
-                }
-                this.episodesOfCare = listOf(
-                    MtbEpisodeOfCare().apply {
-                        this.id = "1"
-                        this.patient = Reference().apply {
-                            this.id = "PID"
-                        }
-                        this.period = PeriodDate().apply {
-                            this.start = Date.from(Instant.now())
-                        }
-                    }
-                )
-            }
-        }
-
-        fun bwhcV1kafkaRecordData(requestId: RequestId, consentStatus: Consent.Status): MtbRequest {
-            return BwhcV1MtbFileRequest(requestId, bwhcV1MtbFile(consentStatus))
-        }
-
-        fun dnmpV2kafkaRecordData(requestId: RequestId): MtbRequest {
-            return DnpmV2MtbFileRequest(requestId, dnpmV2MtbFile())
         }
 
         data class TestData(val requestStatus: RequestStatus, val exception: Throwable? = null)
@@ -354,4 +231,4 @@ class KafkaMtbFileSenderTest {
         }
     }
 
-}
+}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/RestBwhcMtbFileSenderTest.kt

@@ -30,16 +30,16 @@ import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.params.ParameterizedTest
+import org.junit.jupiter.params.provider.Arguments
 import org.junit.jupiter.params.provider.MethodSource
-import org.springframework.http.HttpHeaders
 import org.springframework.http.HttpMethod
 import org.springframework.http.HttpStatus
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.retry.policy.SimpleRetryPolicy
 import org.springframework.retry.support.RetryTemplateBuilder
 import org.springframework.test.web.client.ExpectedCount
 import org.springframework.test.web.client.MockRestServiceServer
-import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.*
+import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.method
+import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.requestTo
 import org.springframework.test.web.client.response.MockRestResponseCreators.withStatus
 import org.springframework.web.client.RestTemplate
 
@@ -73,7 +73,7 @@ class RestBwhcMtbFileSenderTest {
                 withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
             }
 
-        val response = restMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
         assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
         assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
     }
@@ -84,12 +84,11 @@ class RestBwhcMtbFileSenderTest {
         this.mockRestServiceServer
             .expect(method(HttpMethod.POST))
             .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/mtbfile/MTBFile"))
-            .andExpect(header(HttpHeaders.CONTENT_TYPE, MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE))
             .andRespond {
                 withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
             }
 
-        val response = restMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
         assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
         assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
     }
@@ -119,7 +118,7 @@ class RestBwhcMtbFileSenderTest {
                 withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
             }
 
-        val response = restMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
         assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
         assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
     }
@@ -149,7 +148,7 @@ class RestBwhcMtbFileSenderTest {
                 withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
             }
 
-        val response = restMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
         assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
         assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
     }
@@ -310,4 +309,4 @@ class RestBwhcMtbFileSenderTest {
     }
 
 
-}
+}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/output/RestDipMtbFileSenderTest.kt

@@ -22,8 +22,6 @@ package dev.dnpm.etl.processor.output
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import com.fasterxml.jackson.module.kotlin.KotlinModule
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
-import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Patient
-import dev.dnpm.etl.processor.CustomMediaType
 import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
 import dev.dnpm.etl.processor.RequestId
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfigProperties
@@ -31,208 +29,136 @@ import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfiguration
 import dev.dnpm.etl.processor.config.RestTargetProperties
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.ReportService
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.*
+import dev.dnpm.etl.processor.output.RestBwhcMtbFileSenderTest.Companion
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
-import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.params.ParameterizedTest
 import org.junit.jupiter.params.provider.MethodSource
-import org.springframework.http.HttpHeaders
 import org.springframework.http.HttpMethod
 import org.springframework.http.HttpStatus
-import org.springframework.http.MediaType
 import org.springframework.retry.backoff.NoBackOffPolicy
 import org.springframework.retry.policy.SimpleRetryPolicy
 import org.springframework.retry.support.RetryTemplateBuilder
 import org.springframework.test.web.client.ExpectedCount
 import org.springframework.test.web.client.MockRestServiceServer
-import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.*
+import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.method
+import org.springframework.test.web.client.match.MockRestRequestMatchers.requestTo
 import org.springframework.test.web.client.response.MockRestResponseCreators.withStatus
 import org.springframework.web.client.RestTemplate
-import java.time.Instant
-import java.util.*
 
 class RestDipMtbFileSenderTest {
 
-    @Nested
+    private lateinit var mockRestServiceServer: MockRestServiceServer
-    inner class BwhcV1ContentRequest {
 
-        private lateinit var mockRestServiceServer: MockRestServiceServer
+    private lateinit var restMtbFileSender: RestMtbFileSender
 
-        private lateinit var restMtbFileSender: RestMtbFileSender
+    private var reportService = ReportService(ObjectMapper().registerModule(KotlinModule.Builder().build()))
 
-        private var reportService = ReportService(ObjectMapper().registerModule(KotlinModule.Builder().build()))
+    @BeforeEach
+    fun setup() {
+        val restTemplate = RestTemplate()
+        val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
+        val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
 
-        @BeforeEach
+        this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-        fun setup() {
-            val restTemplate = RestTemplate()
-            val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
-
-            this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-
-            this.restMtbFileSender =
-                RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.RestDipMtbFileSenderTest#mtbFileRequestWithResponseSource")
-        fun shouldReturnExpectedResponseForMtbFilePost(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-            this.mockRestServiceServer
-                .expect(method(HttpMethod.POST))
-                .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient-record"))
-                .andExpect(header(HttpHeaders.CONTENT_TYPE, MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE))
-                .andRespond {
-                    withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-                }
-
-            val response = restMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, bwhcV1mtbFile))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
-            assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.RestDipMtbFileSenderTest#mtbFileRequestWithResponseSource")
-        fun shouldRetryOnMtbFileHttpRequestError(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-            val restTemplate = RestTemplate()
-            val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
-            val retryTemplate = AppConfiguration().retryTemplate(AppConfigProperties("http://localhost:9000"))
-            retryTemplate.setBackOffPolicy(NoBackOffPolicy())
-
-            this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-            this.restMtbFileSender =
-                RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
-
-            val expectedCount = when (requestWithResponse.httpStatus) {
-                // OK - No Retry
-                HttpStatus.OK, HttpStatus.CREATED, HttpStatus.UNPROCESSABLE_ENTITY, HttpStatus.BAD_REQUEST -> ExpectedCount.max(
-                    1
-                )
-                // Request failed - Retry max 3 times
-                else -> ExpectedCount.max(3)
-            }
-
-            this.mockRestServiceServer
-                .expect(expectedCount, method(HttpMethod.POST))
-                .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient-record"))
-                .andRespond {
-                    withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-                }
-
-            val response = restMtbFileSender.send(BwhcV1MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, bwhcV1mtbFile))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
-            assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
-        }
 
+        this.restMtbFileSender = RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
     }
 
-    @Nested
+    @ParameterizedTest
-    inner class DnpmV2ContentRequest {
+    @MethodSource("deleteRequestWithResponseSource")
-
+    fun shouldReturnExpectedResponseForDelete(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-        private lateinit var mockRestServiceServer: MockRestServiceServer
+        this.mockRestServiceServer
-
+            .expect(method(HttpMethod.DELETE))
-        private lateinit var restMtbFileSender: RestMtbFileSender
+            .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient/${TEST_PATIENT_PSEUDONYM.value}"))
-
+            .andRespond {
-        private var reportService = ReportService(ObjectMapper().registerModule(KotlinModule.Builder().build()))
+                withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-
-        @BeforeEach
-        fun setup() {
-            val restTemplate = RestTemplate()
-            val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
-
-            this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-
-            this.restMtbFileSender = RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.RestDipMtbFileSenderTest#mtbFileRequestWithResponseSource")
-        fun shouldReturnExpectedResponseForDnpmV2MtbFilePost(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-            this.mockRestServiceServer
-                .expect(method(HttpMethod.POST))
-                .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient-record"))
-                .andExpect(header(HttpHeaders.CONTENT_TYPE, CustomMediaType.APPLICATION_VND_DNPM_V2_MTB_JSON_VALUE))
-                .andRespond {
-                    withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-                }
-
-            val response = restMtbFileSender.send(DnpmV2MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, dnpmV2MtbFile()))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
-            assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
-        }
-
-    }
-
-    @Nested
-    inner class DeleteRequest {
-
-        private lateinit var mockRestServiceServer: MockRestServiceServer
-
-        private lateinit var restMtbFileSender: RestMtbFileSender
-
-        private var reportService = ReportService(ObjectMapper().registerModule(KotlinModule.Builder().build()))
-
-        @BeforeEach
-        fun setup() {
-            val restTemplate = RestTemplate()
-            val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
-            val retryTemplate = RetryTemplateBuilder().customPolicy(SimpleRetryPolicy(1)).build()
-
-            this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-
-            this.restMtbFileSender =
-                RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.RestDipMtbFileSenderTest#deleteRequestWithResponseSource")
-        fun shouldReturnExpectedResponseForDelete(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-            this.mockRestServiceServer
-                .expect(method(HttpMethod.DELETE))
-                .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient/${TEST_PATIENT_PSEUDONYM.value}"))
-                .andRespond {
-                    withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-                }
-
-            val response = restMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
-            assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
-            assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
-        }
-
-        @ParameterizedTest
-        @MethodSource("dev.dnpm.etl.processor.output.RestDipMtbFileSenderTest#deleteRequestWithResponseSource")
-        fun shouldRetryOnDeleteHttpRequestError(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
-            val restTemplate = RestTemplate()
-            val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
-            val retryTemplate = AppConfiguration().retryTemplate(AppConfigProperties("http://localhost:9000"))
-            retryTemplate.setBackOffPolicy(NoBackOffPolicy())
-
-            this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
-            this.restMtbFileSender =
-                RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
-
-            val expectedCount = when (requestWithResponse.httpStatus) {
-                // OK - No Retry
-                HttpStatus.OK, HttpStatus.CREATED, HttpStatus.UNPROCESSABLE_ENTITY, HttpStatus.BAD_REQUEST -> ExpectedCount.max(
-                    1
-                )
-                // Request failed - Retry max 3 times
-                else -> ExpectedCount.max(3)
             }
 
-            this.mockRestServiceServer
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
-                .expect(expectedCount, method(HttpMethod.DELETE))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
-                .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient/${TEST_PATIENT_PSEUDONYM.value}"))
+        assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
-                .andRespond {
+    }
-                    withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
-                }
 
-            val response = restMtbFileSender.send(DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+    @ParameterizedTest
-            assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
+    @MethodSource("mtbFileRequestWithResponseSource")
-            assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
+    fun shouldReturnExpectedResponseForMtbFilePost(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
+        this.mockRestServiceServer
+            .expect(method(HttpMethod.POST))
+            .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient-record"))
+            .andRespond {
+                withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
+            }
+
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
+        assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
+    }
+
+    @ParameterizedTest
+    @MethodSource("mtbFileRequestWithResponseSource")
+    fun shouldRetryOnMtbFileHttpRequestError(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
+        val restTemplate = RestTemplate()
+        val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
+        val retryTemplate = AppConfiguration().retryTemplate(AppConfigProperties("http://localhost:9000"))
+        retryTemplate.setBackOffPolicy(NoBackOffPolicy())
+
+        this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
+        this.restMtbFileSender =
+            RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
+
+        val expectedCount = when (requestWithResponse.httpStatus) {
+            // OK - No Retry
+            HttpStatus.OK, HttpStatus.CREATED, HttpStatus.UNPROCESSABLE_ENTITY, HttpStatus.BAD_REQUEST -> ExpectedCount.max(
+                1
+            )
+            // Request failed - Retry max 3 times
+            else -> ExpectedCount.max(3)
         }
 
+        this.mockRestServiceServer
+            .expect(expectedCount, method(HttpMethod.POST))
+            .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient-record"))
+            .andRespond {
+                withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
+            }
+
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.MtbFileRequest(TEST_REQUEST_ID, mtbFile))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
+        assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
+    }
+
+    @ParameterizedTest
+    @MethodSource("deleteRequestWithResponseSource")
+    fun shouldRetryOnDeleteHttpRequestError(requestWithResponse: RequestWithResponse) {
+        val restTemplate = RestTemplate()
+        val restTargetProperties = RestTargetProperties("http://localhost:9000/api", null, null, false)
+        val retryTemplate = AppConfiguration().retryTemplate(AppConfigProperties("http://localhost:9000"))
+        retryTemplate.setBackOffPolicy(NoBackOffPolicy())
+
+        this.mockRestServiceServer = MockRestServiceServer.createServer(restTemplate)
+        this.restMtbFileSender =
+            RestDipMtbFileSender(restTemplate, restTargetProperties, retryTemplate, reportService)
+
+        val expectedCount = when (requestWithResponse.httpStatus) {
+            // OK - No Retry
+            HttpStatus.OK, HttpStatus.CREATED, HttpStatus.UNPROCESSABLE_ENTITY, HttpStatus.BAD_REQUEST -> ExpectedCount.max(
+                1
+            )
+            // Request failed - Retry max 3 times
+            else -> ExpectedCount.max(3)
+        }
+
+        this.mockRestServiceServer
+            .expect(expectedCount, method(HttpMethod.DELETE))
+            .andExpect(requestTo("http://localhost:9000/api/mtb/etl/patient/${TEST_PATIENT_PSEUDONYM.value}"))
+            .andRespond {
+                withStatus(requestWithResponse.httpStatus).body(requestWithResponse.body).createResponse(it)
+            }
+
+        val response = restMtbFileSender.send(MtbFileSender.DeleteRequest(TEST_REQUEST_ID, TEST_PATIENT_PSEUDONYM))
+        assertThat(response.status).isEqualTo(requestWithResponse.response.status)
+        assertThat(response.body).isEqualTo(requestWithResponse.response.body)
     }
 
     companion object {
@@ -245,7 +171,7 @@ class RestDipMtbFileSenderTest {
         val TEST_REQUEST_ID = RequestId("TestId")
         val TEST_PATIENT_PSEUDONYM = PatientPseudonym("PID")
 
-        val bwhcV1mtbFile: MtbFile = MtbFile.builder()
+        val mtbFile: MtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
                 Patient.builder()
                     .withId("PID")
@@ -269,29 +195,6 @@ class RestDipMtbFileSenderTest {
             )
             .build()
 
-        fun dnpmV2MtbFile(): Mtb {
-            return Mtb().apply {
-                this.patient = dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Patient().apply {
-                    this.id = "PID"
-                    this.birthDate = Date.from(Instant.now())
-                    this.gender = GenderCoding().apply {
-                        this.code = GenderCodingCode.MALE
-                    }
-                }
-                this.episodesOfCare = listOf(
-                    MtbEpisodeOfCare().apply {
-                        this.id = "1"
-                        this.patient = Reference().apply {
-                            this.id = "PID"
-                        }
-                        this.period = PeriodDate().apply {
-                            this.start = Date.from(Instant.now())
-                        }
-                    }
-                )
-            }
-        }
-
         private const val ERROR_RESPONSE_BODY = "Sonstiger Fehler bei der Übertragung"
 
         /**
@@ -408,4 +311,4 @@ class RestDipMtbFileSenderTest {
     }
 
 
-}
+}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/ExtensionsTest.kt

@@ -1,7 +1,7 @@
 /*
  * This file is part of ETL-Processor
  *
- * Copyright (c) 2025  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
+ * Copyright (c) 2023  Comprehensive Cancer Center Mainfranken, Datenintegrationszentrum Philipps-Universität Marburg and Contributors
  *
  * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published
@@ -21,10 +21,7 @@ package dev.dnpm.etl.processor.pseudonym
 
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
-import de.ukw.ccc.bwhc.dto.Patient
-import dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.*
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
-import org.junit.jupiter.api.Nested
 import org.junit.jupiter.api.Test
 import org.junit.jupiter.api.assertThrows
 import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith
@@ -34,242 +31,168 @@ import org.mockito.kotlin.anyValueClass
 import org.mockito.kotlin.doAnswer
 import org.mockito.kotlin.whenever
 import org.springframework.core.io.ClassPathResource
-import java.time.Instant
+
-import java.util.*
+const val FAKE_MTB_FILE_PATH = "fake_MTBFile.json"
+const val CLEAN_PATIENT_ID = "5dad2f0b-49c6-47d8-a952-7b9e9e0f7549"
 
 @ExtendWith(MockitoExtension::class)
 class ExtensionsTest {
 
-    @Nested
+    private fun fakeMtbFile(): MtbFile {
-    inner class UsingBwhcDatamodel {
+        val mtbFile = ClassPathResource(FAKE_MTB_FILE_PATH).inputStream
-
+        return ObjectMapper().readValue(mtbFile, MtbFile::class.java)
-        val FAKE_MTB_FILE_PATH = "fake_MTBFile.json"
-        val CLEAN_PATIENT_ID = "5dad2f0b-49c6-47d8-a952-7b9e9e0f7549"
-
-        private fun fakeMtbFile(): MtbFile {
-            val mtbFile = ClassPathResource(FAKE_MTB_FILE_PATH).inputStream
-            return ObjectMapper().readValue(mtbFile, MtbFile::class.java)
-        }
-
-        private fun MtbFile.serialized(): String {
-            return ObjectMapper().writeValueAsString(this)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldNotContainCleanPatientId(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            val mtbFile = fakeMtbFile()
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-
-            assertThat(mtbFile.patient.id).isEqualTo("PSEUDO-ID")
-            assertThat(mtbFile.serialized()).doesNotContain(CLEAN_PATIENT_ID)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldNotContainAnyUuidAfterRehashingOfIds(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            doAnswer {
-                "TESTDOMAIN"
-            }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
-
-            val mtbFile = fakeMtbFile()
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-            mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
-
-            val pattern = "\"[a-f0-9]{8}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{12}\"".toRegex().toPattern()
-            val matcher = pattern.matcher(mtbFile.serialized())
-
-            assertThrows<IllegalStateException> {
-                matcher.find()
-                matcher.group()
-            }.also {
-                assertThat(it.message).isEqualTo("No match found")
-            }
-
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldRehashIdsWithPrefix(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            doAnswer {
-                "TESTDOMAIN"
-            }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
-
-            val mtbFile = MtbFile.builder()
-                .withPatient(
-                    Patient.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withBirthDate("2000-08-08")
-                        .withGender(Patient.Gender.MALE)
-                        .build()
-                )
-                .withConsent(
-                    Consent.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withStatus(Consent.Status.ACTIVE)
-                        .withPatient("123")
-                        .build()
-                )
-                .withEpisode(
-                    Episode.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withPatient("1")
-                        .withPeriod(PeriodStart("2023-08-08"))
-                        .build()
-                )
-                .build()
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-            mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
-
-
-            assertThat(mtbFile.episode.id)
-                // TESTDOMAIN<sha256(TESTDOMAIN-1)[0-41]>
-                .isEqualTo("TESTDOMAIN44e20a53bbbf9f3ae39626d05df7014dcd77d6098")
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldNotThrowExceptionOnNullValues(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            doAnswer {
-                "TESTDOMAIN"
-            }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
-
-            val mtbFile = MtbFile.builder()
-                .withPatient(
-                    Patient.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withBirthDate("2000-08-08")
-                        .withGender(Patient.Gender.MALE)
-                        .build()
-                )
-                .withConsent(
-                    Consent.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withStatus(Consent.Status.ACTIVE)
-                        .withPatient("123")
-                        .build()
-                )
-                .withEpisode(
-                    Episode.builder()
-                        .withId("1")
-                        .withPatient("1")
-                        .withPeriod(PeriodStart("2023-08-08"))
-                        .build()
-                )
-                .withClaims(null)
-                .withDiagnoses(null)
-                .withCarePlans(null)
-                .withClaimResponses(null)
-                .withEcogStatus(null)
-                .withFamilyMemberDiagnoses(null)
-                .withGeneticCounsellingRequests(null)
-                .withHistologyReevaluationRequests(null)
-                .withHistologyReports(null)
-                .withLastGuidelineTherapies(null)
-                .withMolecularPathologyFindings(null)
-                .withMolecularTherapies(null)
-                .withNgsReports(null)
-                .withPreviousGuidelineTherapies(null)
-                .withRebiopsyRequests(null)
-                .withRecommendations(null)
-                .withResponses(null)
-                .withStudyInclusionRequests(null)
-                .withSpecimens(null)
-                .build()
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-            mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
-
-            assertThat(mtbFile.episode.id).isNotNull()
-        }
     }
 
-    @Nested
+    private fun MtbFile.serialized(): String {
-    inner class UsingDnpmV2Datamodel {
+        return ObjectMapper().writeValueAsString(this)
-
-        val FAKE_MTB_FILE_PATH = "mv64e-mtb-fake-patient.json"
-        val CLEAN_PATIENT_ID = "644bae7a-56f6-4ee8-b02f-c532e65af5b1"
-
-        private fun fakeMtbFile(): Mtb {
-            val mtbFile = ClassPathResource(FAKE_MTB_FILE_PATH).inputStream
-            return ObjectMapper().readValue(mtbFile, Mtb::class.java)
-        }
-
-        private fun Mtb.serialized(): String {
-            return ObjectMapper().writeValueAsString(this)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldNotContainCleanPatientId(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            val mtbFile = fakeMtbFile()
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-
-            assertThat(mtbFile.patient.id).isEqualTo("PSEUDO-ID")
-            assertThat(mtbFile.serialized()).doesNotContain(CLEAN_PATIENT_ID)
-        }
-
-        @Test
-        fun shouldNotThrowExceptionOnNullValues(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
-            doAnswer {
-                it.arguments[0]
-                "PSEUDO-ID"
-            }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
-
-            doAnswer {
-                "TESTDOMAIN"
-            }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
-
-            val mtbFile = Mtb().apply {
-                this.patient = dev.pcvolkmer.mv64e.mtb.Patient().apply {
-                    this.id = "PID"
-                    this.birthDate = Date.from(Instant.now())
-                    this.gender = GenderCoding().apply {
-                        this.code = GenderCodingCode.MALE
-                    }
-                }
-                this.episodesOfCare = listOf(
-                    MtbEpisodeOfCare().apply {
-                        this.id = "1"
-                        this.patient = Reference().apply {
-                            this.id = "PID"
-                        }
-                        this.period = PeriodDate().apply {
-                            this.start = Date.from(Instant.now())
-                        }
-                    }
-                )
-            }
-
-            mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
-            mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
-
-            assertThat(mtbFile.episodesOfCare).hasSize(1)
-            assertThat(mtbFile.episodesOfCare.map { it.id }).isNotNull
-        }
     }
-}
+
+    @Test
+    fun shouldNotContainCleanPatientId(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
+        doAnswer {
+            it.arguments[0]
+            "PSEUDO-ID"
+        }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
+
+        val mtbFile = fakeMtbFile()
+
+        mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
+
+        assertThat(mtbFile.patient.id).isEqualTo("PSEUDO-ID")
+        assertThat(mtbFile.serialized()).doesNotContain(CLEAN_PATIENT_ID)
+    }
+
+    @Test
+    fun shouldNotContainAnyUuidAfterRehashingOfIds(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
+        doAnswer {
+            it.arguments[0]
+            "PSEUDO-ID"
+        }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
+
+        doAnswer {
+            "TESTDOMAIN"
+        }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
+
+        val mtbFile = fakeMtbFile()
+
+        mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
+        mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
+
+        val pattern = "\"[a-f0-9]{8}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{4}-[a-f0-9]{12}\"".toRegex().toPattern()
+        val matcher = pattern.matcher(mtbFile.serialized())
+
+        assertThrows<IllegalStateException> {
+            matcher.find()
+            matcher.group()
+        }.also {
+            assertThat(it.message).isEqualTo("No match found")
+        }
+
+    }
+
+    @Test
+    fun shouldRehashIdsWithPrefix(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
+        doAnswer {
+            it.arguments[0]
+            "PSEUDO-ID"
+        }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
+
+        doAnswer {
+            "TESTDOMAIN"
+        }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
+
+        val mtbFile = MtbFile.builder()
+            .withPatient(
+                Patient.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withBirthDate("2000-08-08")
+                    .withGender(Patient.Gender.MALE)
+                    .build()
+            )
+            .withConsent(
+                Consent.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withStatus(Consent.Status.ACTIVE)
+                    .withPatient("123")
+                    .build()
+            )
+            .withEpisode(
+                Episode.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withPatient("1")
+                    .withPeriod(PeriodStart("2023-08-08"))
+                    .build()
+            )
+            .build()
+
+        mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
+        mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
+
+
+       assertThat(mtbFile.episode.id)
+           // TESTDOMAIN<sha256(TESTDOMAIN-1)[0-41]>
+           .isEqualTo("TESTDOMAIN44e20a53bbbf9f3ae39626d05df7014dcd77d6098")
+    }
+
+    @Test
+    fun shouldNotThrowExceptionOnNullValues(@Mock pseudonymizeService: PseudonymizeService) {
+        doAnswer {
+            it.arguments[0]
+            "PSEUDO-ID"
+        }.whenever(pseudonymizeService).patientPseudonym(anyValueClass())
+
+        doAnswer {
+            "TESTDOMAIN"
+        }.whenever(pseudonymizeService).prefix()
+
+        val mtbFile = MtbFile.builder()
+            .withPatient(
+                Patient.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withBirthDate("2000-08-08")
+                    .withGender(Patient.Gender.MALE)
+                    .build()
+            )
+            .withConsent(
+                Consent.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withStatus(Consent.Status.ACTIVE)
+                    .withPatient("123")
+                    .build()
+            )
+            .withEpisode(
+                Episode.builder()
+                    .withId("1")
+                    .withPatient("1")
+                    .withPeriod(PeriodStart("2023-08-08"))
+                    .build()
+            )
+            .withClaims(null)
+            .withDiagnoses(null)
+            .withCarePlans(null)
+            .withClaimResponses(null)
+            .withEcogStatus(null)
+            .withFamilyMemberDiagnoses(null)
+            .withGeneticCounsellingRequests(null)
+            .withHistologyReevaluationRequests(null)
+            .withHistologyReports(null)
+            .withLastGuidelineTherapies(null)
+            .withMolecularPathologyFindings(null)
+            .withMolecularTherapies(null)
+            .withNgsReports(null)
+            .withPreviousGuidelineTherapies(null)
+            .withRebiopsyRequests(null)
+            .withRecommendations(null)
+            .withResponses(null)
+            .withStudyInclusionRequests(null)
+            .withSpecimens(null)
+            .build()
+
+        mtbFile.pseudonymizeWith(pseudonymizeService)
+        mtbFile.anonymizeContentWith(pseudonymizeService)
+
+
+        assertThat(mtbFile.episode.id).isNotNull()
+    }
+
+}

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/pseudonym/PseudonymizeServiceTest.kt

@@ -72,7 +72,7 @@ class PseudonymizeServiceTest {
 
     @Test
     fun sanitizeFileName(@Mock generator: GpasPseudonymGenerator) {
-        val result = GpasPseudonymGenerator.sanitizeValue("l://a\\bs;1*2?3>")
+        val result= GpasPseudonymGenerator.sanitizeValue("l://a\\bs;1*2?3>")
 
         assertThat(result).isEqualTo("l___a_bs_1_2_3_")
     }
@@ -90,10 +90,4 @@ class PseudonymizeServiceTest {
         assertThat(mtbFile.patient.id).isEqualTo("UNKNOWN_123")
     }
 
-    @Test
-    fun shouldReturnDifferentValues() {
-        val ag = AnonymizingGenerator()
-        val tan = ag.generateGenomDeTan("12345")
-        assertThat(tan).hasSize(64)
-    }
 }

src/test/kotlin/dev/dnpm/etl/processor/services/RequestProcessorTest.kt

@@ -21,19 +21,14 @@ package dev.dnpm.etl.processor.services
 
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
 import de.ukw.ccc.bwhc.dto.*
-import dev.dnpm.etl.processor.Fingerprint
+import dev.dnpm.etl.processor.*
-import dev.dnpm.etl.processor.PatientId
-import dev.dnpm.etl.processor.PatientPseudonym
 import dev.dnpm.etl.processor.config.AppConfigProperties
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.Request
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestStatus
 import dev.dnpm.etl.processor.monitoring.RequestType
-import dev.dnpm.etl.processor.output.BwhcV1MtbFileRequest
-import dev.dnpm.etl.processor.output.DeleteRequest
 import dev.dnpm.etl.processor.output.MtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.output.RestMtbFileSender
 import dev.dnpm.etl.processor.pseudonym.PseudonymizeService
-import dev.dnpm.etl.processor.randomRequestId
 import org.assertj.core.api.Assertions.assertThat
 import org.junit.jupiter.api.BeforeEach
 import org.junit.jupiter.api.Test
@@ -114,7 +109,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             it.arguments[0]
-        }.whenever(transformationService).transform(any<MtbFile>())
+        }.whenever(transformationService).transform(any())
 
         val mtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
@@ -173,7 +168,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             it.arguments[0]
-        }.whenever(transformationService).transform(any<MtbFile>())
+        }.whenever(transformationService).transform(any())
 
         val mtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
@@ -228,7 +223,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.SUCCESS)
-        }.whenever(sender).send(any<BwhcV1MtbFileRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.MtbFileRequest>())
 
         doAnswer {
             it.arguments[0] as String
@@ -236,7 +231,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             it.arguments[0]
-        }.whenever(transformationService).transform(any<MtbFile>())
+        }.whenever(transformationService).transform(any())
 
         val mtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
@@ -291,7 +286,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.ERROR)
-        }.whenever(sender).send(any<BwhcV1MtbFileRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.MtbFileRequest>())
 
         doAnswer {
             it.arguments[0] as String
@@ -299,7 +294,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             it.arguments[0]
-        }.whenever(transformationService).transform(any<MtbFile>())
+        }.whenever(transformationService).transform(any())
 
         val mtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
@@ -341,7 +336,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.UNKNOWN)
-        }.whenever(sender).send(any<DeleteRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.DeleteRequest>())
 
         this.requestProcessor.processDeletion(TEST_PATIENT_ID)
 
@@ -359,7 +354,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.SUCCESS)
-        }.whenever(sender).send(any<DeleteRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.DeleteRequest>())
 
         this.requestProcessor.processDeletion(TEST_PATIENT_ID)
 
@@ -377,7 +372,7 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.ERROR)
-        }.whenever(sender).send(any<DeleteRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.DeleteRequest>())
 
         this.requestProcessor.processDeletion(TEST_PATIENT_ID)
 
@@ -409,11 +404,11 @@ class RequestProcessorTest {
 
         doAnswer {
             it.arguments[0]
-        }.whenever(transformationService).transform(any<MtbFile>())
+        }.whenever(transformationService).transform(any())
 
         doAnswer {
             MtbFileSender.Response(status = RequestStatus.SUCCESS)
-        }.whenever(sender).send(any<BwhcV1MtbFileRequest>())
+        }.whenever(sender).send(any<MtbFileSender.MtbFileRequest>())
 
         val mtbFile = MtbFile.builder()
             .withPatient(
@@ -451,4 +446,4 @@ class RequestProcessorTest {
         val TEST_PATIENT_ID = PatientId("TEST_12345678901")
     }
 
-}
+}