pcvolkmer/onkostar-plugin-dnpm
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/pcvolkmer/onkostar-plugin-dnpm.git synced 2025-07-01 17:02:53 +00:00
Code Issues Activity

feat: add SQL query examples

Browse Source
This commit is contained in:
Paul-Christian Volkmer
2025-06-11 19:52:15 +02:00
parent 35e9558ab4
commit 83e85a6c1e
1 changed files with 193 additions and 0 deletions
Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

193
sql/sql-queries.md Normal file
View File

@ -0,0 +1,193 @@
# SQL-Queries für DNPM-Formulare
## Abfrage von weiteren Informationen zu Merkmalskatalogeinträgen (Propcat)
Angenommen eine Abfrage liefert für dk_molekulargenetik.entnahmemethode den Wert B und
die zugehörige Version in dk_molekulargenetik.entnahmemethode_propcat_version ist 1171:
```
SELECT code, shortdesc, description FROM property_catalogue_version_entry
WHERE code = 'B'
AND property_version_id = 1171
```
Diese Abfrage liefert B, Biopsie, Biopsie.
## Stammdaten zum Patienten anhand SAP-ID für den Personenstamm z.B. 4.
```
SELECT * FROM patient
WHERE patient.patienten_id = '?' AND patient.personenstamm = 4;
```
## Diagnosedaten zur Erkrankung
```
SELECT dk_diagnose.* FROM dk_diagnose
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_diagnose.id)
JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
```
## Formular DNPM Klinik/Anamnese inkl. Unterformulare
Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID:
```
SELECT dk_dnpm_kpa.* FROM dk_dnpm_kpa
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_kpa.id)
JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
```
## Unterformular Histologie(en)
```
SELECT dk_dnpm_uf_histologie.* FROM dk_dnpm_uf_histologie
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_histologie.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
## Unterformular ECOG Performance Status Verlauf
```
SELECT dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.* FROM dk_dnpm_uf_tumorausbreitung
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
## Unterformular Tumorerkrankung bei Verwandten
```
SELECT dk_dnpm_uf_verwandte.* FROM dk_dnpm_uf_verwandte
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_verwandte.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
## Unterformular Molekularpathologische Vorbefunde
```
SELECT dk_dnpm_vorbefunde.* FROM dk_dnpm_vorbefunde
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_vorbefunde.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
## Unterformular Therapielinien
Achtung: Hier enthält der Tabellenname nicht den Bestandteil 'uf' für Unterformular.
```
SELECT dk_dnpm_therapielinie.* FROM dk_dnpm_therapielinie
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapielinie.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
Im Feld wirkstoffcodes sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da
Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
| Name | Bedeutung |
|-----------|-----------------------------------------|
| system | Das verwendete System. ATC oder "other" |
| code | Der verwendete Wirkstoffcode |
| substance | Der Name des Wirkstoffs |
Beispiel:
```
[
{"system":"other","code":"Gemcitabin","substance":"Gemcitabin (dFdC)"},
{"system":"other","code":"Cisplatin ","substance":"Cisplatin (CDDP)"}
]
```
## Formular DNPM Therapieplan inkl. Unterformulare
Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID:
```
SELECT dk_dnpm_therapieplan.* FROM dk_dnpm_therapieplan
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapieplan.id)
JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
```
Alternativ mit Verweis auf DNPM Klinik/Anamnese
```
...
WHERE dk_dnpm_therapieplan.ref_dnpm_klinikanamnese = ?;
```
### Unterformular Reevaluation
```
SELECT dk_dnpm_uf_reevaluation .* FROM dk_dnpm_uf_reevaluation
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_reevaluation .id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
Achtung! Gegebenenfalls ist vor dem erneuten Bearbeiten des Formulars der Inhalt eines
einzelnen Reevaluationsauftrags direkt im Hauptformular gespeichert. In dem Fall sind keine
Unterformulare zur Reevaluation gespeichert.
### Unterformular Rebiopsie
```
SELECT dk_dnpm_uf_rebiopsie.* FROM dk_dnpm_uf_rebiopsie
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_rebiopsie.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
### Unterformular Einzelempfehlung
```
SELECT dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.* FROM dk_dnpm_uf_einzelempfehlung
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.id)
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
```
#### Wirkstoffe
Im Feld wirkstoffe_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da
Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
| Name | Bedeutung |
|--------|--------------------------------------------------|
| system | Das verwendete System. "ATC" oder "UNREGISTERED" |
| code | Der verwendete Wirkstoffcode |
| name | Der Name des Wirkstoffs |
Beispiel:
```
[
{"code":"","name":"PARP-Inhibierung","system":"UNREGISTERED"}
]
```
#### Studien
Im Feld studien_alle_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert,
da Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
| Name | Bedeutung |
|-------------------------|-----------------------------|
| studie | Name der Studie |
| system | System der Studie(n-ID) |
| id (und alt auch "nct") | Die Studien-ID |
| ort | Ort der Studiendurchführung |
| internextern | intern (i) oder extern (e) |
Beispiel:
```
[
{"studie":"TestInhibitor","system":"NCT","id":"NCT12345678","nct":"NCT12345678","ort":"Teststadt","internextern":"e"}
]
```