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feat: add SQL query examples
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sql/sql-queries.md
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@ -0,0 +1,193 @@
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# SQL-Queries für DNPM-Formulare
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## Abfrage von weiteren Informationen zu Merkmalskatalogeinträgen (Propcat)
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Angenommen eine Abfrage liefert für dk_molekulargenetik.entnahmemethode den Wert B und
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die zugehörige Version in dk_molekulargenetik.entnahmemethode_propcat_version ist 1171:
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```
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SELECT code, shortdesc, description FROM property_catalogue_version_entry
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WHERE code = 'B'
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AND property_version_id = 1171
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```
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Diese Abfrage liefert B, Biopsie, Biopsie.
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## Stammdaten zum Patienten anhand SAP-ID für den Personenstamm z.B. 4.
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```
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SELECT * FROM patient
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WHERE patient.patienten_id = '?' AND patient.personenstamm = 4;
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```
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## Diagnosedaten zur Erkrankung
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```
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SELECT dk_diagnose.* FROM dk_diagnose
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_diagnose.id)
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JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
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JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
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JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
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WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
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```
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## Formular DNPM Klinik/Anamnese inkl. Unterformulare
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Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID:
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```
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SELECT dk_dnpm_kpa.* FROM dk_dnpm_kpa
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_kpa.id)
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JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
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JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
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JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
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WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
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```
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## Unterformular Histologie(en)
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_histologie.* FROM dk_dnpm_uf_histologie
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_histologie.id)
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WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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## Unterformular ECOG Performance Status Verlauf
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.* FROM dk_dnpm_uf_tumorausbreitung
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.id)
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WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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## Unterformular Tumorerkrankung bei Verwandten
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_verwandte.* FROM dk_dnpm_uf_verwandte
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_verwandte.id)
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WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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## Unterformular Molekularpathologische Vorbefunde
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```
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SELECT dk_dnpm_vorbefunde.* FROM dk_dnpm_vorbefunde
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_vorbefunde.id)
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WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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## Unterformular Therapielinien
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Achtung: Hier enthält der Tabellenname nicht den Bestandteil 'uf' für Unterformular.
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```
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SELECT dk_dnpm_therapielinie.* FROM dk_dnpm_therapielinie
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapielinie.id)
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WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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Im Feld wirkstoffcodes sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da
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Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
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| Name | Bedeutung |
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|-----------|-----------------------------------------|
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| system | Das verwendete System. ATC oder "other" |
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| code | Der verwendete Wirkstoffcode |
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| substance | Der Name des Wirkstoffs |
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Beispiel:
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```
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[
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{"system":"other","code":"Gemcitabin","substance":"Gemcitabin (dFdC)"},
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{"system":"other","code":"Cisplatin ","substance":"Cisplatin (CDDP)"}
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]
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```
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## Formular DNPM Therapieplan inkl. Unterformulare
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Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID:
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```
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SELECT dk_dnpm_therapieplan.* FROM dk_dnpm_therapieplan
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapieplan.id)
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JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id)
|
||||
JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id)
|
||||
JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id)
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||||
WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?;
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```
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Alternativ mit Verweis auf DNPM Klinik/Anamnese
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```
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...
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WHERE dk_dnpm_therapieplan.ref_dnpm_klinikanamnese = ?;
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```
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### Unterformular Reevaluation
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_reevaluation .* FROM dk_dnpm_uf_reevaluation
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_reevaluation .id)
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||||
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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Achtung! Gegebenenfalls ist vor dem erneuten Bearbeiten des Formulars der Inhalt eines
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einzelnen Reevaluationsauftrags direkt im Hauptformular gespeichert. In dem Fall sind keine
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Unterformulare zur Reevaluation gespeichert.
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### Unterformular Rebiopsie
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_rebiopsie.* FROM dk_dnpm_uf_rebiopsie
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||||
JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_rebiopsie.id)
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||||
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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### Unterformular Einzelempfehlung
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```
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SELECT dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.* FROM dk_dnpm_uf_einzelempfehlung
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JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.id)
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||||
WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?;
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```
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#### Wirkstoffe
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Im Feld wirkstoffe_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da
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Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
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| Name | Bedeutung |
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|--------|--------------------------------------------------|
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| system | Das verwendete System. "ATC" oder "UNREGISTERED" |
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| code | Der verwendete Wirkstoffcode |
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||||
| name | Der Name des Wirkstoffs |
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||||
Beispiel:
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```
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[
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{"code":"","name":"PARP-Inhibierung","system":"UNREGISTERED"}
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]
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```
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#### Studien
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Im Feld studien_alle_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert,
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da Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann:
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| Name | Bedeutung |
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|-------------------------|-----------------------------|
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| studie | Name der Studie |
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| system | System der Studie(n-ID) |
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| id (und alt auch "nct") | Die Studien-ID |
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| ort | Ort der Studiendurchführung |
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| internextern | intern (i) oder extern (e) |
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Beispiel:
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[
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{"studie":"TestInhibitor","system":"NCT","id":"NCT12345678","nct":"NCT12345678","ort":"Teststadt","internextern":"e"}
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]
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```
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