mirror of
https://github.com/pcvolkmer/bzkf-rwdp-check.git
synced 2025-04-19 19:16:51 +00:00
59 lines
1.9 KiB
Markdown
59 lines
1.9 KiB
Markdown
# BZKF Real World Data Platform - Plausibilitätsprüfung
|
|
|
|
Anwendung zur Durchführung einer Plausibilitätsprüfung anhand der Daten für die BZKF Real World Data Platform.
|
|
|
|
## Aufbau der ETL-Strecke an den Standorten
|
|
|
|
Die Daten werden aus der Onkostar-Datenbank ausgelesen und in Apache-Kafka eingespeist.
|
|
Nach Durchlauf der ETL-Strecke wird das Ergebnis in einer CSV-Datei gespeichert.
|
|
Diese wird dann (aktuell) manuell in OPAL importiert.
|
|
|
|
```mermaid
|
|
flowchart LR
|
|
A[Database] --> B[Kafka-Connect]
|
|
B --> C[ADT to FHIR]
|
|
C --> D[fhir-pseudonymizer]
|
|
D --> E[obds-fhir-to-opal]
|
|
E -->|CSV-File| F[OPAL]
|
|
```
|
|
|
|
## Ermittelte Kennzahlen
|
|
|
|
Die Anwendung gibt für die möglichen Quellen der Kennzahlen die Anzahl der _Conditions_, gruppiert nach ICD-10 Gruppen,
|
|
aus.
|
|
|
|
|
|
|
|
## Kennzahlen aus der CSV-Datei
|
|
|
|
Vor Veröffentlichung der Daten der CSV-Datei in Opal kann die Anzahl der _Conditions_, gruppiert nach ICD-10 Gruppen,
|
|
mit dem Befehl `opal-file` aus der CSV-Datei gewonnen werden.
|
|
|
|
```
|
|
bzkf-rwdp-check opal-file --file <Opal-CSV-Datei>.csv
|
|
```
|
|
|
|
Die Anwendung gibt nun eine Liste der ICD-10-Gruppen mit Anzahl der _Conditions_ aus.
|
|
|
|
## Kennzahlen aus der Onkostar-Datenbank
|
|
|
|
Die Anzahl der _Conditions_, gruppiert nach ICD-10-Gruppe, kann auch mit dem Befehl `database` aus der Onkostar-Datenbank
|
|
abgerufen werden.
|
|
|
|
```
|
|
bzkf-rwdp-check database --user me --year 2024
|
|
```
|
|
|
|
Die Anwendung gibt auch hier eine Liste der ICD-10-Gruppen mit Anzahl der _Conditions_ aus.
|
|
|
|
Dieser Befehl hat noch weitere Parameter:
|
|
|
|
```
|
|
Options:
|
|
-D, --database <DATABASE> Datenbank-Name [default: onkostar]
|
|
-h, --host <HOST> Datenbank-Host [default: localhost]
|
|
-P, --port <PORT> Datenbank-Host [default: 3306]
|
|
-p, --password <PASSWORD> Passwort. Wenn nicht angegeben, wird danach gefragt
|
|
-u, --user <USER> Benutzername
|
|
-y, --year <YEAR> Jahr der Diagnose
|
|
``` |