pcvolkmer/mv64e-onkostar-data
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feat: add MSI mapping as far as possible

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Paul-Christian Volkmer
2025-08-21 10:45:36 +02:00
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commit 09843349d9
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README.md
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@@ -54,7 +54,7 @@ Um Mithilfe wird gebeten.
| vorherige Molekular-Diagnostik | ✅ | |
| Histologie-Berichte | ✅ | |
| IHC-Berichte | - | Aktuell nicht vorgesehen |
| MSI-Befunde | ⌛ | Aktuell in Arbeit, https://github.com/dnpm-dip/mtb-model/issues/10 ist behoben |
| MSI-Befunde | ⛅ | Best effort: Formular OS.Molekulargenetik erfüllt nicht alle Anforderungen (2) |
| NGS-Berichte | ⛅ | Best effort: Formular OS.Molekulargenetik erfüllt nicht alle Anforderungen (2) |
| MTB-Beschlüsse | ✅ | Stützende molekulare Alteration(en) für einfache Variante und CNV (3) |
| Follow-Up Verlauf | - | Späterer Zeitpunkt |
@@ -67,7 +67,10 @@ Um Mithilfe wird gebeten.
1. Nicht alle möglichen Ausprägungen in `OS.Molekulargenetik` vorhanden.
2. Aktuell nicht alle Angaben effektiv im Formular `OS.Molekulargenetik` wie gefordert angebbar.
Hinweis: Tumorzellgehalt-Methode problematisch, wenn auch im NGS-Bericht histologisch festgestellt.
Hinweise:
* Tumorzellgehalt-Methode problematisch, wenn auch im NGS-Bericht histologisch festgestellt.
* Angabe zu MSI-Interpretation fehlt in Formular, ist aber Pflichtangabe - Wird gefiltert.
* Datenbanktabelle für MSI lautet tatsächlich `dk_molekluargenmsi` [sic!]
3. Implementierung des Mappings von HGNC-Symbol (Gen-Name) zu HGNC-ID über enthaltene Gen-Liste.
## Enthaltene Liste mit Genen