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mirror of https://github.com/pcvolkmer/mv64e-onkostar-data.git synced 2025-07-03 02:52:54 +00:00
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Datenextraktion aus den Onkostar DNPM-Formularen

Ziel dieser Library ist die Bereitstellung von Methoden zum Laden von Daten der DNPM-Formulare aus der Onkostar-Datenbank und dem Mapping in das DNPM-Datenmodell 2.1.

Beispiel

Beispiel zur Konfiguration der Datenbankanbindung, Abruf über eine Fallnummer im Formular DNPM Klinik/Anamnese und Serialisierung als JSON-String.

var datasource = new MariaDbDataSource();
datasource.setUrl("jdbc:mariadb://localhost:3306/onkostar");
datasource.setUser("onkostar");
datasource.setPassword("devpass");

var mtbMapper = MtbDataMapper.create(datasource);

var jsonResult = Converter.toJsonString(
  mtbMapper.getByCaseId("16000123")
);

Es ist auch möglich, die Daten anhand der Patienten-ID und dem Tumoridentifikator zu ermitteln. Hierbei wird das letzte Formular DNPM Klinik/Anamnese andhand des Anmeldedatums MTB ausgewählt und verwendet.

...

var jsonResult = Converter.toJsonString(
  mtbMapper.getLatestByPatientIdAndTumorId("2000123456", 1))
);

Status

DNPM-Datenmodell 2.1 - Bereich Status Anmerkung
Patient Verwendet Datenbank-ID, keine managing Site
Episoden
Diagnosen Entsprechend Formularaufbau nur Diagnose der aktuellen Episode
Verwandten-Diagnosen
Systemische Leitlinien-Therapien Siehe auch: https://github.com/dnpm-dip/mtb-model/issues/9
Leitlinien-Prozeduren Siehe auch: https://github.com/dnpm-dip/mtb-model/issues/9
ECOG-Verlauf
Tumor-Proben Aktuell in Arbeit
vorherige Molekular-Diagnostik Aktuell in Arbeit
Histologie-Berichte Aktuell in Arbeit
IHC-Berichte
MSI-Befunde
NGS-Berichte Aktuell in Arbeit
MTB-Beschlüsse Aktuell in Arbeit
Follow-Up Verlauf
Antrag Kostenübernahme
Antwort Kostenübernahme
Therapien
Response Befunde
Description
Ziel dieser Library ist die Bereitstellung von Methoden zum Laden von Daten der DNPM-Formulare aus der Onkostar-Datenbank und dem Mapping in das DNPM-Datenmodell 2.1
Readme 359 KiB
Languages
Java 100%